[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 6، شماره 2 - ( 12-1396 ) ::
جلد 6 شماره 2 صفحات 293-307 برگشت به فهرست نسخه ها
بررسی تاثیر قارچکش ایپرودیون-کاربندازیم (رورال‌ تی ‌اس) بر ساختار جمعیت باکتری‌های ریزوسفر خیار به روش Illumina MiSeq sequencing
رباب اعزازی، مسعود احمدزاده ، محمد جوان‌نیکخواه، رضا صالحی محمدی، کلادیو دوناتی
گروه گیاهپزشکی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران
چکیده:   (151 مشاهده)
مطالعه تاثیرات قارچکش‌ها بر جوامع میکروبی ریزوسفر و خاک به دلیل نقش مهم و برجسته میکروارگانیسم‌ها در سلامت گیاه و خاک، بسیار حائز اهمیت است. در این پژوهش، تاثیر قارچکش رورال‌ تی‌ اس بر دینامیک و ساختار جمعیت باکتری‌های ریزوسفر خیار به روش توالی‌یابی نسل بعدی مبتنی بر ژن 16S rRNA (ناحیه V4) با استفاده از روش  Illumina MiSeq sequencing، در سه مرحله رشدی گیاه مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که از بین 26 شاخه  و 352 جنس باکتریایی شناسایی شده برای 18 نمونه، در مجموع شاخه Proteobacteria و جنس Pseudomonas بیشترین فراوانی را داشتند. کاربرد قارچکش رورال ‌تی ‌اس سبب تغییر در ساختار و دینامیک جمعیت باکتریایی شد؛ کاهش فراوانی نسبی جنس Pseudomonas در مرحله اواسط گلدهی در تیمار قارچکش و مرحله آخر گلدهی در نمونه‌های شاهد مشاهده شد. علاوه بر این، فراوانی نسبی جنس‌هایSphingopyxis ، Sphingobacterium و Chryseobacterim در گیاهان تیمار شده با قارچکش در هر سه مرحله، بیشتر از گیاهان شاهد بود. تجزیه و تحلیل شاخص‌های تنوع نشان داد که در مجموع خاک ریزوسفری گیاهان شاهد از تنوع بیشتری نسبت به خاک ریزوسفری گیاهان تیمار شده با رورال‌تی‌اس برخوردار بودند (شانون=33/5)، ولی از نظر  غنای گونه سهم خاک مربوط به تیمار رورال ‌تی‌اس بیشتر بود (17/2434Chao1=). علاوه بر این، مرحله رشدی گیاه بر تعداد OTU، شاخص تنوع و غنای گونه‌ای (صرفنظر از نوع تیمار)، معنی‌دار بوده و خاک ریزوسفری گیاهان در مرحله قبل از گلدهی از بیشترین تعداد OTU، تنوع و غنا برخوردار می‌باشد.
 
واژه‌های کلیدی: اکولوژی میکروبی، آفتکش‌های شیمیایی، متاژنومیکس
متن کامل [PDF 1169 kb]   (94 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ایمنی زیستی
دریافت: ۱۳۹۶/۱۱/۱۶ | پذیرش: ۱۳۹۷/۲/۲۹ | انتشار: ۱۳۹۷/۲/۳۱
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA code


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Ezazi R, Ahmadzadeh M, Javan Nikkhah M, Salehi-Mohammadi R, Donati C. Evaluation the effects of fungicide Iprodione-Carbendazim (Rovral TS) on cucumber rhizosphere bacterial structure by Illumina MiSeq sequencing. Genetic Engineering and Biosafety Journal. 2018; 6 (2) :293-307
URL: http://gebsj.ir/article-1-237-fa.html

اعزازی رباب، احمدزاده مسعود، جوان‌نیکخواه محمد، صالحی محمدی رضا، دوناتی کلادیو. بررسی تاثیر قارچکش ایپرودیون-کاربندازیم (رورال‌ تی ‌اس) بر ساختار جمعیت باکتری‌های ریزوسفر خیار به روش Illumina MiSeq sequencing. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1396; 6 (2) :293-307

URL: http://gebsj.ir/article-1-237-fa.html



دوره 6، شماره 2 - ( 12-1396 ) برگشت به فهرست نسخه ها
دوفصل نامه علمی-پژوهشی مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی Genetic Engineering and Biosafety Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.07 seconds with 30 queries by YEKTAWEB 3764