[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 6، شماره 1 - ( 4-1396 ) ::
جلد 6 شماره 1 صفحات 37-48 برگشت به فهرست نسخه ها
ههمسانه‌سازی، مطالعه بیوانفورماتیکی و بررسی بیان ژن سکوالن ‌سینتاز1 در شیرین‌بیان بومی ایران
زهرا شیرازی، علی اعلمی ، مسعود توحیدفر، محمد مهدی سوهانی
گروه بیوتکنولوژی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، ایران
چکیده:   (556 مشاهده)
شیرین‌بیان (Glycyrrhiza glabra)، یکی از مهم­ترین گیاهان دارویی است که دارای ترکیبات فعال زیستی مانند ساپونین تری‌ترپنوئیدها (گلیسیریزین) و فیتواسترول‌ها است. سکوالن سینتاز (Squalene Synthase)، آنزیم (EC 2.5.1.21) متصل به غشا است که دو مولکول فارنسیل دی­‌فسفات را به سکوالن تبدیل می‌کند. سکوالن پیش ماده اصلی بیوسنتز تری‌ترپن‌ها و استرول‌ها است. در این مطالعه توالی بیان کننده سکوالن ‌سینتاز 1 شیرین‌بیان بومی ایران در وکتور pTZ57R/T همسانه‌سازی و ویژگی‌های بیوانفورماتیکی پلی­‌پپتید با استفاده از نرم‌افزارها پیش‌بینی شد. cDNA سکوالن ‌سینتاز 1، 1242 جفت باز دارد و یک پلی‌پپتید 413 آمینواسیدی را بیان می‌کند. بررسی‌های بیوانفورماتیکی نشان داد که پلی­‌پپتید سکوالن سینتاز 1 شیرین‌بیان، بیشترین شباهت را با سکوالن ‌سینتاز 1 جنس Glycyrrhiza دارد. بررسی جایگاه درون­ سلولی نشان داد که فعالیت پروتئین در ارتباط با شبکه آندوپلاسمی است. وزن مولکولی پروتئین 3/47 کیلودالتون و نقطه ایزوالکتریک آن 18/8 است. در توالی آمینواسیدی دو ناحیه فراغشایی و دو بخش حفاظت ­شده مشخص شد. ساختار سه­ بعدی پروتئین با استفاده از نرم‌افزار I-TASSER پیشگویی شد. در ساختار پروتئین پیشگویی شده، مارپیچ فراغشایی، آمینواسیدهای آب­گریز، توالی حفاظت شده و آمینواسیدهای سطح پروتئین با نرم‌افزار Chimera مشخص شد. الگوی بیان ژن سکوالن ‌سینتاز 1 نشان داد که بیشترین و کمترین بیان به‌ترتیب مربوط به ریشه و اندام سبز گیاه است.
 
واژه‌های کلیدی: ترپنوئید، RT-PCR کمی، فیتواسترول، گلیسیریزین، همسانه سازی cDNA
متن کامل [PDF 514 kb]   (56 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: مهندسی ژنتیک گیاهی
دریافت: ۱۳۹۵/۱۰/۱۴ | پذیرش: ۱۳۹۶/۴/۱۹ | انتشار: ۱۳۹۶/۵/۱۹
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

کد امنیتی را در کادر بنویسید >



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Shirazi Z, Aalami A, Tohidfar M, Sohani M M. Cloning, bioinformatics study and gene expression evaluation of Squalene Synthase 1 in Iranian native licorice . Genetic Engineering and Biosafety Journal. 2017; 6 (1) :37-48
URL: http://gebsj.ir/article-1-160-fa.html
شیرازی زهرا، اعلمی علی، توحیدفر مسعود، سوهانی محمد مهدی. ههمسانه‌سازی، مطالعه بیوانفورماتیکی و بررسی بیان ژن سکوالن ‌سینتاز1 در شیرین‌بیان بومی ایران. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1396; 6 (1) :37-48

URL: http://gebsj.ir/article-1-160-fa.html

دوره 6، شماره 1 - ( 4-1396 ) برگشت به فهرست نسخه ها
دوفصل نامه علمی-پژوهشی مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی Genetic Engineering and Biosafety Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 799 queries by yektaweb 3531