|
مطالعه شبکه ژنی موثر بر رشد ماهیچه سینه جوجه راس تحت داده‌های RNA-Seq
|
سید نادر آلبوشوکه   ، مجتبی طهمورث پور* ، محمدرضا بختیاری زاده ، محمدرضا نصیری ، سعید اسماعیل خانیان |
| گروه علوم دامی ، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران ، Tahmoores@um.ac.ir |
|
|
چکیده: (6023 مشاهده) |
جوجه های بومی جز مهم‌ترین ذخایر ژنتیکی هستند که به شرایط محیطی بخوبی سازگاری یافته‌اند. اما بطور معمول سرعت رشد و راندمان غذایی آنها در مقایسه با جوجه‌های امروزی مناسب است. مطالعات مقایسه‌ای بین جوجه‌های امروزی و مرغان بومی امکان درک علل این تفاوت‌های ژنتیکی را مهیا می‌سازد. جهت بررسی تفاوت‌های ترانسکریپتومی ژن‌ها و مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با رشد ماهیچه سینه در دو گروه مرغ بومی و جوجه تجاری از مطالعات ژنومی تکنولوژی‌های توالی‌یابی نسل آینده استفاده شد. در این پژوهش تعداد 200 قطعه پرنده از سویه راس 708 و 200 قطعه جوجه بومی اصفهان در یک شرایط مشابه مدیریتی و تغذیه استاندارد پرورش داده شدند. در بررسی تجزیه و تحلیل داده‌هایRNA-Seq بین دو گروه آزمایشی، پروفایل بیان ژن در 4 نمونه ماهیچه سینه 28 روزگی عمر جوجه‌ها مورد مقایسه قرار گرفت. مقایسه آماری بیان ژن‌های توالی‌یابی شده در این دو گروه، 606 ژن با تفاوت معنی‌دار را مشخص کرد. در جوجه تجاری از این تعداد 357 ژن افزایش بیان و 249 ژن کاهش بیان نشان دادند. شبکه برهم کنش پروتئین- پروتئین (Protein-protein interaction) با استفاده از 267 ژن تشکیل و از این تعداد 75 ژن در قالب سه ماژول با حداکثر سطح معنی‌داری شناسایی شد. بررسی‌های هستی شناسی ژنی نشان داد هر سه ماژول در رشد ونموی ماهیچه سینه نقش موثری را ایفا کرده و ژن‌های شاخص آنها JUN، EGR1، THBS1، ITGA4 و ACTA2 بودند.
|
|
| واژه‌های کلیدی: جوجه راس، شبکه ژنی، میوژن، هستی شناسی ژن، RNA-Seq |
|
|
متن کامل [PDF 1010 kb]
(4146 دریافت)
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
مهندسی ژنتیک جانوری
دریافت: 1396/6/1 | پذیرش: 1396/6/15 | انتشار: 1396/12/15
|
|
|
|
|
|
