[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
برای داوران::
ثبت نام و اشتراک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
بایگانی مقالات زیر چاپ::
::
::
شماره‌های چاپ شده

فایل لیست داوران مقالات دوره یازدهم

دوره دوازدهم سال 1402
شماره اول
شماره دوم

دوره یازدهم سال 1401
شماره اول
شماره دوم
دوره دهم سال 1400
شماره اول
شماره دوم
دوره نهم سال 1399
شماره اول
شماره دوم
دوره هشتم سال 1398
شماره اول
شماره دوم

دوره هفتم سال 1397
دوره ششم سال 1396
دوره پنجم سال 1395
دوره چهارم سال 1394
دوره سوم سال 1393
دوره دوم سال 1392
دوره اول سال 1391
..
راهنمای نگارش
..
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
:: دوره 11، شماره 1 - ( 2-1401 ) ::
جلد 11 شماره 1 صفحات 41-25 برگشت به فهرست نسخه ها
شناسایی ژن‌های نامزد دخیل در تحمل به خشکی ارزن دم‌روباهی با استفاده از رویکرد متاآنالیز تلفیقی
فاطمه لونی ، احمد اسماعیلی* ، زهرا سادات شبر* ، بابک ناخدا ، هادی درزی رامندی
موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران ، shobbar@abrii.ac.ir
چکیده:   (1617 مشاهده)
تنش خشکی یکی از مهمترین عوامل محدود کننده تولید در بخش کشاورزی است. استفاده از گیاهان جایگزین متحمل به خشکی با کارآیی مصرف آب بالا از اهمیت به‌سزایی برخوردار است. ارزن دم‌روباهی (Setaria italicaL.) یکی از غلات مهم غذایی و علوفه­ ای متحمل به خشکی در مناطق خشک و نیمه‌خشک است. در این مطالعه، QTLهای شناسایی شده در شرایط آبیاری معمول و تنش خشکی، از مقالات مختلف گردآوری و روی نقشه ژنتیکی تلفیقی کروموزوم‌های ارزن مکان‌یابی شدند. از مجموع هشت مطالعه مستقل، تعداد 386 QTL مرتبط با صفات ارتفاع گیاه، کارایی مصرف آب، زیست توده، طول ریشه و طول پانیکول در ارزن دم‌روباهی جمع‌آوری شد. در شرایط آبیاری عادی و تنش خشکی به ترتیب تعداد 287 و 96‌ ناحیه QTL جمع‌آوری شد و روی نقشه مرجع ژنتیکی قرار ‌گرفتند. متاآنالیز QTLها با استفاده از نرم‌افزار  BioMercator در نسخه 2/4 صورت گرفت. در مجموع تعداد 32 ناحیه متا QTL (MQTL) روی نه کروموزوم ارزن دم‌روباهی شناسایی شد که به طور میانگین فاصله اطمینان نواحی MQTL به نسبت 4/3 برابر کم‌تر از فاصله اطمینان QTLهای اولیه در مجموع صفات مورد بررسی بود. به‌منظور بررسی الگوی بیان ژنها در نواحی MQTL، داده های ریزآرایه و RNA-seq موجود در پایگاه دادهها مورد آنالیز قرار گرفتند. از این بین تعداد 95 و 2172 ژن دارای بیان افتراقی در شرایط خشکی به ترتیب در چهار ناحیه MQTL با CI کمتر از یک میلیون جفت باز و در تمام مناطق MQTLها شناسایی‌شدند. در آنالیز "هاب" تعداد هشت ژن کلیدی شناسایی شد که جزو گروه عوامل تنظیمی و فاکتورهای رونویسی بودند. امید است نتایج این مطالعه بتواند در راستای گزینش مبتنی بر نشانگر (MAS) و استفاده در برنامه‌های به‌نژادی ارزن دم‌روباهی با هدف معرفی ژنوتیپ‌های برتر متحمل به خشکی مورد استفاده قرار گیرد.
شماره‌ی مقاله: 3
واژه‌های کلیدی: ارزن دم‌روباهی، تنش خشکی، نواحی MQTL، ژنهای دارای بیان افتراقی، آنالیز هاب
متن کامل [PDF 1365 kb]   (315 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: مهندسی ژنتیک گیاهی
دریافت: 1401/1/28 | پذیرش: 1401/2/27 | انتشار: 1401/3/3
ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Loni F, Ismaili A, Shobbar Z, Nakhoda B, Darzi Ramandi H. Identification of the drought tolerance involved candidate genes in foxtail millet through an integrated meta-analysis approach. Genetic Engineering and Biosafety Journal 2022; 11 (1) : 3
URL: http://gebsj.ir/article-1-416-fa.html

لونی فاطمه، اسماعیلی* احمد، شبر زهرا سادات، ناخدا بابک، درزی رامندی هادی. شناسایی ژن‌های نامزد دخیل در تحمل به خشکی ارزن دم‌روباهی با استفاده از رویکرد متاآنالیز تلفیقی. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1401; 11 (1) :25-41

URL: http://gebsj.ir/article-1-416-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 11، شماره 1 - ( 2-1401 ) برگشت به فهرست نسخه ها
دوفصل نامه علمی-پژوهشی مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی Genetic Engineering and Biosafety Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.07 seconds with 39 queries by YEKTAWEB 4645