<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Genetic Engineering and Biosafety Journal</title>
<title_fa>مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی</title_fa>
<short_title>gebsj</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://gebsj.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2588-5073</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2588-5081</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>1</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61882/gebsj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>11</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>1111</journal_id_nlai>
<journal_id_science>11</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1395</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2017</year>
	<month>1</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>5</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی و تعیین توالی ژن مربوط به آنتی پورتر هیدروژن/ سدیم از غشای پلاسمایی گیاه Kochia scoparia</title_fa>
	<title>Characterization and sequence of a hydrogen/sodium anti-porter gene in the plasma membrane of the plant Kochia scoparia</title>
	<subject_fa>مهندسی ژنتیک گیاهی</subject_fa>
	<subject>Plant</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;یکی از راهکارهای گیاهان برای کاهش مقدار سدیم سیتوزولی، دفع سدیم به خارج سلول است. این دفع خارج سلولی، مانع از اثرهای سمی سدیم در فرآیندهای سلولی سیتوزول می&amp;shy;شود. ناقل&#8204;های سدیم/هیدروژن غشای پلاسمایی (&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;SOS&lt;sub&gt;1&lt;/sub&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;) یکی از بهترین پروتئین&#8204;های درگیر در این فرآیند هستند. &lt;span style=&quot;color:#231F20;&quot;&gt;در این پژوهش از گیاه دولپه و شورزی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#231F20;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;Kochia scoparia&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#231F20;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; به عنوان منبع برای جداسازی ژن استفاده شد. بر همین اساس با استفاده از آغازگرهای طراحی شده در مناطق حفاظت شده در گیاهان دیگر، طول تقریبی 3600 نوکلئوتیدی و به تبعیت از آن توالی 1200 اسید&amp;shy;آمینه&#8204;ای از توالی کد&amp;shy;کنندۀ این ژن شناسایی و تعیین توالی&#8204; شد. میزان شباهت این توالی در سطح نوکلئوتیدی با حداکثر 84 درصد همولوژی و در سطح اسید&amp;shy;آمینه&#8204;ای 92 درصد با استفاده از بررسی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#231F20;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;BLAST&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#231F20;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; تأیید شد. تجزیه و تحلیل&amp;shy;های بعدی برای تعیین خصوصیات پروتئینی و ارتباط&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#231F20;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;آن با پروتئین&#8204;های دیگر با استفاده از مطالعات بیوانفورماتیک انجام شد و نتایج نشان داد که منطقه حاوی مارپیچ&#8204;های آلفای آبگریز به عنوان قطعۀ گذرنده از غشای پلاسمایی است و در مقابل آن دنبالۀ با تعداد کمتر &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;مارپیچ&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&amp;shy;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;های&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#231F20;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; آلفای و خاصیت آبدوستی به عنوان قطعۀ داخل سلولی پروتئین می&#8204;باشد. این نتایج نقش دفع سدیم توسط ناقل&#8204;های غشای پلاسمایی را برای وجود واکنش مقاومت به شوری در گیاه کوشیا تأیید نمود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;Sodium efflux is one way to reducing of cytosolic sodium in plants. This prevents toxic effects of sodium on cytosol cellular processes. Sodium/hydrogen transporters in the plasma membrane (SOS&lt;sub&gt;1&lt;/sub&gt;) are one of the best known proteins in this process. In this study &lt;em&gt;Kochia scoparia, &lt;/em&gt;a halophyte dicotyledonous plant was used as a source to gene isolation. Using designed primers based on conserved regions of other plants, a gene coding sequence of approximate 3600 nucleotides and 1200 amino acids was identified and sequenced. Analysis with BLAST verified that maximum nucleotide homology of the sequence with other SOS&lt;sub&gt;1 &lt;/sub&gt;proteins was 84%, and in amino acid homology 92%. Additional &lt;em&gt;in silico&lt;/em&gt; analysis was performed to characterize the putative protein and its relation with other SOS&lt;sub&gt;1 &lt;/sub&gt;proteins, which contain a hydrophilic alpha helix region as passenger fragment through plasma membrane and in contrast to this, a sequence with less alpha helix and hydrophilic properties, is as protein intracellular fragment. These results support the role of sodium efflux for resistance response to salinity in Kochia using plasma membrane transporters.&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>جداسازی ژن, شوری, کوشیا, ناقل‌های غشای پلاسمایی</keyword_fa>
	<keyword>gene isolation, Kochia scoparia, plasma membrane transporters, salinity</keyword>
	<start_page>113</start_page>
	<end_page>122</end_page>
	<web_url>http://gebsj.ir/browse.php?a_code=A-10-150-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Nahid</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Nikkhah</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>ناهید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نیکخواه</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846001480</code>
	<orcid>10031947532846001480</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Leila</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name> Fahmideh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>لیلا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فهمیده</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Leila.fahmideh@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846001481</code>
	<orcid>10031947532846001481</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of plant Breeding and Biotechnology, University of Zabol, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ziba</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Fooladvand </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>زیبا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فولادوند</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>zibafooladvand83@gmail.com</email>
	<code>10031947532846001482</code>
	<orcid>10031947532846001482</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Assistant of Agriculture and Biotechnology Research Institute, university of Zabol.</affiliation>
	<affiliation_fa>پژوهشکده کشاورزی و پژوهشکده زیست فناوری کشاورزی دانشگاه زابل</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
