<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Genetic Engineering and Biosafety Journal</title>
<title_fa>مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی</title_fa>
<short_title>gebsj</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://gebsj.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2588-5073</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2588-5081</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>1</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61882/gebsj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>11</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>1111</journal_id_nlai>
<journal_id_science>11</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1394</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2015</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>4</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی بیوانفوماتیکی ژن مقاومت به سویه آسیایی باکتری عامل بیماری میوه سبز مرکبات در گیاه گریپ فروت</title_fa>
	<title>Isolation, cloning and bioinformatic study of a resistance gene against an Asian strain of citrus greening librobacter in grapefruit plant</title>
	<subject_fa>مهندسی ژنتیک گیاهی</subject_fa>
	<subject>Plant</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;بیماری میوه سبز مرکبات از جمله مهم&#8204;ترین بیماری&#8204;های باکتریایی مرکبات در مناطق جنوبی کشور است. با توجه به ماهیت بیماری، استفاده از ارقام مقاوم مناسب&#8204;ترین راه&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&amp;shy;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;کار در جهت مبارزه با این بیماری است. &lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;اخیرا، &lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;مطالعه جامع برهمکنش میزبان-پاتوژن و شناسایی ژن&amp;shy;های دخیل در این برهمکنش، نشان داد که در گریپ &amp;shy;فروت متحمل به این بیماری&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;،&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt; بیان یک ژن آنالوگ مقاومت متعلق به خانواده &lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Nucleotide Binding Site- Leucien-Rich Repeats (NBS-LRR)&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt; افزایش می&amp;shy;یابد. در این تحقیق جداسازی ژن&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;(&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;NBS552&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;) با آغازگرهای اختصاصی از &lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;گریپ&amp;shy; فروت به روش&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt; صورت گرفت و در پلاسمید &lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;pGEM-T&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt; همسانه &amp;shy;سازی شد. آنالیز توالی&amp;shy;یابی نشان داد که چارچوب بازخوانی این ژن 171 جفت باز است و پروتئین با طول &lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;57 اسید امینه را کد می&amp;shy;کند. &lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;نتایج بررسی&amp;shy;های بیوانفورماتیکی نشان داد که این ژن در بین گونه&amp;shy; های گیاهی دارای توالی&amp;shy;های حفاظتی بالایی است و احتمالا ترشح پروتئین &lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;NBS552&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;در غشاء پلاسمایی و ترشح خارج سلولی آن ناچیز است. هدف این مطالعه &amp;nbsp;جداسازی &amp;nbsp;و همسانه سازی ژن &lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;NBS552&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt; از ژنوم گیاه گریپ&amp;shy; فروت &amp;nbsp;و تعیین مشخصات آن به &amp;nbsp;منظور استفاده کاربردی در گیاهان است. &lt;/strong&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;c&amp;zwj;itrus greening disease is the most important bacterial diseases of citrus and is present in the southern region of Iran. Due to the nature of the pathogen, disease control is difficult. cDNA-AFLP analysis shows that the expression pattern of NBS-LRR (Nucleotide Binding Site- Leucine-Rich Repeats) genes was upregulated in grapefruit plant interacting with &lt;em&gt;Candidatus&lt;/em&gt; Leiberibacter aciaticus. In this study we have isolated the &lt;em&gt;NBS552 &lt;/em&gt;gene from grapefruit by PCR and clone it by ligation of this product to pGEM-T vector transformed &lt;em&gt;E. coli&lt;/em&gt; bacteria. Sequencing analysis revealed an open reading frame for a gene of 171 bp that encodes a protein of 57 amino acids. Results of bioinformatic analysis showed that this gene contains regions that are conserved in different plant species. The NBS552 protein is associated with membranes and its extracellular secretion is low. The aim of this study was isolation and cloning of &lt;em&gt;NBS552&lt;/em&gt; genes from the grapefruit genome and characterization of the genes in view of their potential for practical use in plants.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;/p&gt;</abstract>
	<keyword_fa>گریپ فروت, NBS552 ,میوه سبز مرکبات, مقاومت</keyword_fa>
	<keyword>Grapefruit,C itrus Greening,  Gene NBS552, Resistance</keyword>
	<start_page>125</start_page>
	<end_page>133</end_page>
	<web_url>http://gebsj.ir/browse.php?a_code=A-10-176-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Masoud</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Tohidfar</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مسعود</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>توحید فر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846003144</code>
	<orcid>10031947532846003144</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Biotechnology group, Department of New Technology and Energy Engeenier, Shahid Beheshti University, Tehran, I. R. Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بیوتکنولوژی دانشکده فن‌آوری‌های نوین و مهندسی انرژی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Maryam</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ghayeb Zamharir</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مریم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>غایب زمهریر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846003145</code>
	<orcid>10031947532846003145</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Plant Disease, Iranian Research Institute of Plant Protection (IRIPP), Agricultural Research Education and Extension Organization (AREO), Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش تحقیقات بیماریهای گیاهان، موسسه تحقسقات گیاهپزشکی کشور- سازمان تحقیقات ، آموزش و ترویج کشاورزی- تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
