<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Genetic Engineering and Biosafety Journal</title>
<title_fa>مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی</title_fa>
<short_title>gebsj</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://gebsj.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2588-5073</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2588-5081</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>1</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61882/gebsj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>11</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>1111</journal_id_nlai>
<journal_id_science>11</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1396</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2018</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>6</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی تاثیر قارچکش ایپرودیون-کاربندازیم (رورال‌ تی ‌اس) بر ساختار جمعیت باکتری‌های ریزوسفر خیار به روش Illumina MiSeq sequencing</title_fa>
	<title>Evaluation the effects of fungicide Iprodione-Carbendazim (Rovral TS) on cucumber rhizosphere bacterial structure by Illumina MiSeq sequencing</title>
	<subject_fa>ایمنی زیستی</subject_fa>
	<subject>Biosafety</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;مطالعه تاثیرات قارچکش&#8204;ها بر جوامع میکروبی ریزوسفر و خاک به دلیل نقش مهم و برجسته میکروارگانیسم&#8204;ها در سلامت گیاه و خاک، بسیار حائز اهمیت است. در این پژوهش، تاثیر قارچکش رورال&#8204; تی&#8204; اس بر دینامیک و ساختار جمعیت باکتری&#8204;های ریزوسفر خیار به روش توالی&#8204;یابی نسل بعدی مبتنی بر ژن &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;16S rRNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; (ناحیه &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;V4&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;) با استفاده از روش&amp;nbsp; &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;Illumina MiSeq sequencing&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;، در سه مرحله رشدی گیاه مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که از بین 26 شاخه&amp;nbsp; و 352 جنس باکتریایی شناسایی شده برای 18 نمونه، در مجموع شاخه &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;Proteobacteria&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; و جنس &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;Pseudomonas&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; بیشترین فراوانی را داشتند. کاربرد قارچکش رورال &#8204;تی &#8204;اس سبب تغییر در ساختار و دینامیک جمعیت باکتریایی شد؛ کاهش فراوانی نسبی جنس &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;Pseudomonas&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; در مرحله اواسط گلدهی در تیمار قارچکش و مرحله آخر گلدهی در نمونه&#8204;های شاهد مشاهده شد. علاوه بر&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;این، فراوانی نسبی جنس&#8204;های&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;Sphingopyxis&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;Sphingobacterium&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;Chryseobacterim&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; در گیاهان تیمار شده با قارچکش در هر سه مرحله، بیشتر از گیاهان شاهد بود. تجزیه و تحلیل شاخص&#8204;های تنوع نشان داد که در مجموع خاک ریزوسفری گیاهان شاهد از تنوع بیشتری نسبت به خاک ریزوسفری گیاهان تیمار شده با رورال&#8204;تی&#8204;اس برخوردار بودند (شانون=33/5)، ولی از نظر&amp;nbsp; غنای گونه سهم خاک مربوط به تیمار رورال&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&#8204;تی&#8204;اس بیشتر بود (17/2434&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;Chao1=&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;). علاوه بر این، مرحله رشدی گیاه بر تعداد &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;OTU&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;، شاخص تنوع و غنای گونه&#8204;ای (صرفنظر از نوع تیمار)، معنی&#8204;دار بوده و خاک ریزوسفری گیاهان در مرحله قبل از گلدهی از بیشترین تعداد &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;OTU&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;، تنوع و غنا برخوردار می&#8204;باشد. &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract_fa>
	<abstract>Studying the effects of fungicides on rhizosphere and soil microbial communities is very important due to the critical role of microorganisms in soil and plant health. In this study, the effects of fungicide Rovral TS on dynamic and structure of cucumber rhizospheric bacteria was investigated by Next-Generation Sequencing based on 16S rRNA gene (V4 region) by means of Illumina MiSeq sequencing in three plant growth periods. Results showed that among 26 identified phyla and 352 identified bacterial genera for 18 samples, Proteobacteria and Pseudomonas were most dominate phylum and genus, respectively. Application of Rovral TS was resulted the changes in bacterial structure and dynamic. Decrease of relative abundance of Pseudomonas in middle stage of flowering in fungicide treatment and in the last stage of control treatment was observed. Moreover, the relative abundance of Sphingopyxis, Sphingobacterium and Chryseobacterim in fungicide-treated plants were more than control plant in all three stages. Analysis of diversity indices revealed that diversity in the rhizospheric soil of control plant was more than fungicide-treated plants (shanon=5.33), while species richness in control soil was greater than fungicide treated (Chao1=2324.17). In addition, the effect of plant developing stages on OUT number, diversity and richness indices (regardless type of treatment) was significant and rhizospheric soil belongs to before flowering stages benefit more diversity and richness.&amp;nbsp;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract>
	<keyword_fa>اکولوژی میکروبی, آفتکش‌های شیمیایی, متاژنومیکس</keyword_fa>
	<keyword>microbial ecology, chemical pesticides, metagenomics</keyword>
	<start_page>293</start_page>
	<end_page>307</end_page>
	<web_url>http://gebsj.ir/browse.php?a_code=A-10-265-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Robab</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ezazi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رباب</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اعزازی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>r_ezazi66@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846002018</code>
	<orcid>10031947532846002018</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of plant protection, College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه گیاهپزشکی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Masoud</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ahmadzadeh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مسعود</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>احمدزاده</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ahmadz@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846002019</code>
	<orcid>10031947532846002019</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of plant protection, College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه گیاهپزشکی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Javan Nikkhah</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>جوان‌نیکخواه</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>jnikkhah@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846002020</code>
	<orcid>10031947532846002020</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of plant protection, College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه گیاهپزشکی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Salehi-Mohammadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>صالحی محمدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>salehir@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846002021</code>
	<orcid>10031947532846002021</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Horticultural Sciences, College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه باغبانی،پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Claudio</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Donati</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>کلادیو</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دوناتی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Claudio.donati@fmach.it</email>
	<code>10031947532846002022</code>
	<orcid>10031947532846002022</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Computational Biology Unit, Fondazione Edmund Mach, San Michele all’Adige, Trento, Italy</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست‌شناسی محاسباتی، موسسه ادموند ماخ، سان‌میکله، ترنتو، ایتالیا</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
