<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Genetic Engineering and Biosafety Journal</title>
<title_fa>مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی</title_fa>
<short_title>gebsj</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://gebsj.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2588-5073</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2588-5081</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>1</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61882/gebsj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>11</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>1111</journal_id_nlai>
<journal_id_science>11</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1397</year>
	<month>5</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2018</year>
	<month>8</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>7</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تنوع ژن 2AHP ویروس برگ بادبزنی مو در سطح امینو اسیدی بیشتر از سطح نوکلئوتیدی آن است</title_fa>
	<title>Grapevine fanleaf virus 2AHP gene shows more diversity at amino acid level rather than nucleotide level</title>
	<subject_fa>مهندسی ژنتیک میکروارگانیسم ها و ویروسها</subject_fa>
	<subject>Microrganisms and Viruses</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;span style=&quot;font-family:b lotus;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;ویروس برگ باد بزنی مو (&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;Grapevine fanleaf virus&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;, GFLV&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b lotus;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;) در تاکستان&#8204;های مناطق مختلف دنیا شیوع دارد. علایم ایجاد شده توسط این ویروس اغلب در سه سندرم برگ بادبزنی، موزاییک زرد و رگ نواری تقسیم بندی شده&amp;shy;اند که علت تفاوت در ایجاد علایم به تنوع ژنتیکی جدایه&#8204;ها نسبت داده شده&amp;shy;است. از این&amp;shy;رو در این تحقیق تنوع ژنتیکی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;GFLV 2A&lt;sup&gt;HP&lt;/sup&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b lotus;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; بویژه در جدایه&amp;shy;&amp;shy;&#8204;های همراه با علایم زردی بررسی شد. نمونه&#8204;ها از تاکستان&#8204;های بناب، روستای شیرامین، حسین آباد قزوین و تبریز جمع آوری و ژن &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;2A&lt;sup&gt;HP&lt;/sup&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b lotus;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; در 11 جدایه تکثیر، همسانه&amp;shy;سازی و تعیین ترادف شد. این ژن در سطح نوکلوتیدی و امینواسیدی به ترتیب 27-8/0 و 35-8/0 درصد تنوع داشت که نشانگر تنوع بیشتر در سطح آمینواسیدی نسبت به اسیدهای نوکلئیک است. نتایج آزمون نوترکیبی بر وجود نقطه داغ برای نوترکیبی را تایید نمود. فشار انتخابی این ژن در تمامی بخش&amp;shy;های آن یکسان نبوده به طوری که انتهای آمینی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;2A&lt;sup&gt;HP&lt;/sup&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b lotus;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; متناظر با نوکلئوتیدهای 564-408 بیشتر از 1 بود. وجود جهش&amp;shy;های نقطه&amp;shy;ای که منجر به تغییر امینواسیدها شده&amp;shy;اند به همراه نوترکیبی می&amp;shy;توانند تنوع بیشتر اسیدآمینه&amp;shy;ها در مقایسه با نوکلئوتیدها را در این ناحیه ژنی توجیه کنند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract_fa>
	<abstract>Grapevine fanleaf virus (GFLV) has been reported from vineyards worldwide. The virus causes different symptoms categorized as three distinct syndromes including fanleaf degeneration, yellow mosaic, and vein banding.&amp;nbsp; These variations in the symptoms can be addressed by analysis of genetic diversity of the virus. The aim of the present study was to estimate genetic diversity of the corresponding 2A&lt;sup&gt;HP&lt;/sup&gt; gene in GFLV isolates especially the ones that are associated with the yellow mosaic syndrome. Accordingly, the grapevine samples were collected from vineyards in Bonab, Shir-Amin, Hossein-Abad, and Tabriz in East Azarbaijan Province of Iran. After amplification of GFLV 2A&lt;sup&gt;HP&lt;/sup&gt; gene from the infected samples via RT-PCR, the products were cloned and sequenced.&amp;nbsp; The sequenced GFLV 2A&lt;sup&gt;HP&lt;/sup&gt; gene from 11 different isolates showed 0.8-27% and 0.8-35 % diversity at nucleotide and amino acid levels, respectively, denoting a higher diversity of 2A&lt;sup&gt;HP&lt;/sup&gt; amino acid sequence than its nucleotide sequence. Likewise, presence of a hot spot for recombination events on 2A&lt;sup&gt;HP&lt;/sup&gt; region was explored by the use of recombination analysis. Moreover, it was found that the selection pressure on 2A&lt;sup&gt;HP&lt;/sup&gt; region is not uniformly distributed so that the ratio (dn/ds) for the N-terminus proximity, between the nucleotides 408-564, was more than one. Therefore, synonymus point mutations as well as recombination events might be reason for this evidence.&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract>
	<keyword_fa>مو, ویروس برگ بادبزنی مو, فیلوژنی, ژن 2AHP, تعیین توالی</keyword_fa>
	<keyword>Grapevine, selection pressure, phylogeny, nepoviruses, 2AHP</keyword>
	<start_page>79</start_page>
	<end_page>90</end_page>
	<web_url>http://gebsj.ir/browse.php?a_code=A-10-198-2&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Marziyeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Enteshari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مرضیه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>انتشاری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>m_enteshari@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846002193</code>
	<orcid>10031947532846002193</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Entomology and Plant Pathology, College of Abouraihan, University of Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه حشره شناسی و بیماریهای گیاهی، پردیس ابوریحان، دانشگاه تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Shaheen</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Nourinejhad Zarghani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>شاهین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نوری نژاد زرقانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>sh_nourinejhad@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846002194</code>
	<orcid>10031947532846002194</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Entomology and Plant Pathology, College of Abouraihan, University of Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه حشره شناسی و بیماریهای گیاهی، پردیس ابوریحان، دانشگاه تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Sayed Mohsen</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Nassaj Hosseini</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سیدمحسن</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نساج حسینی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>nassaj20@gmail.com</email>
	<code>10031947532846002195</code>
	<orcid>10031947532846002195</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>ACECR, Gillan Branch, Rasht</affiliation>
	<affiliation_fa>جهاد دانشگاهی واحد استان گیلان، رشت.</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
