Genetic Engineering and Biosafety Journal

fa شناسایی ریز‌RNA‌های نامزد دخیل در تحمل سرما در نخود زراعی Identification of candidate microRNAs involved in cold tolerance of Chickpea مهندسی ژنتیک گیاهی Plant پژوهشي Research <div style="text-align: justify;">نخود (Cicer arietinum) یکی از مهمترین حبوبات است که حساس به سرما بوده و هر ساله کاهش ناگهانی دما منجر به افت عملکرد قابل توجه آن میشود. ریزRNAها، RNAهای کوچک غیررمزکننده بسیار محافظت شده ای هستند که بیان ژن را با تخریب mRNAهای هدف پس از رونویسی یا سرکوب ترجمه آنها تنظیم میکنند و نقش آنها در پاسخ به سرما در گیاهان مختلف به اثبات رسیده است. در این مطالعه، به منظور شناسایی ریزRNAهای پاسخ دهنده به سرما، پس از توالی یابی ترانسکریپتوم در یک رقم متحمل (سارال) و یک لاین حساس به تنش سرما (ILC533)، توالی ژنهای پاسخ دهنده به تنش سرما در نخود با استفاده ازنرم‌‌‌افزار c-mii مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. سپس، ژنهای هدف تعدادی از ریزRNAهای مهم با استفاده از نرمافزار psRNA Target تعیین شدند. نتایج نشان داد که 30 ریزRNA در ژنوتیپ متحمل و 20 ریزRNA در ژنوتیپ حساس نخود به تنش سرما پاسخ دادند. با مقایسه پاسخ ریزRNAها در دو ژنوتیپ مورد بررسی، ریزRNAهایmiR159 ،miR319 ، miR393 و  miR394 به عنوان ریزRNAهای نامزد دخیل در تحمل سرما در نخود تعیین و نقش آنها مورد بررسی دقیق تر قرار گرفت. امید است نتایج به دست آمده در راستای ایجاد ارقام نخود متحمل به سرما مفید واقع شود.</div> <div style="text-align: justify;">Chickpea (Cicer arietinum) is one of the most important legumes, classified as a cold-sensitive species, and each year, the sudden drop in temperature leads to a significant loss of chickpea yield. miRNAs are highly conserved small noncoding RNAs that regulate expression of their target genes by degradation of their mRNAs or suppressing their translation, and their roles have been proved in cold stress response in various plants. In the current study, in order to identify cold stress responsive miRNAs in chickpeas, following transcriptome sequencing of a cold stress tolerant cultivar (Saral) and a cold stress sensitive line (ILC533) in response to cold stress, the sequences of the cold responsive genes were analyzed by c-mii software to identify possible miRNAs. Then, the target genes of a number of important miRNAs were identified using psRNA target software. The results showed that 30 and 20 miRNAs responded to cold stress in the tolerant and sensitive genotypes, respectively. Through comparative analysis of cold responsive miRNAs in the contrasting genotypes, miR319, miR393, miR394 and miR159 were demonstrated as candidate miRNAs involved in cold tolerance and their roles was further inspected. It is hoped that the obtained results will be useful for development of cold tolerant chickpea cultivars.</div> نخود زراعی, پاسخ دهنده به سرما, RNA‌های کوچک غیررمزده, ژن های هدف Cicer arietinum, small noncoding RNAs, Cold responsive, Target genes 42 53 http://gebsj.ir/browse.php?a_code=A-10-117-2&slc_lang=fa&sid=1 Alireza Akbari علیرضا اکبری alireza.akbari001@gmail.com 10031947532846004711 10031947532846004711 No Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran. گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان Ahmad Ismaili احمد اسماعیلی* ismaili.a@lu.ac.ir 10031947532846004712 10031947532846004712 No Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran. گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی دانشگاه لرستان، ایران Zahra-Sadat Shobbar زهرا سادات شبر shobbar@abrii.ac.ir 10031947532846004713 10031947532846004713 Yes Department of Systems Biology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research, Education and Extension Organization, Karaj, Iran گروه پژوهشی زیست‌شناسی سیستمها، پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران Nazanin Amirbakhtiar نازنین امیربختیار nabakhtiar@spii.ir 10031947532846004714 10031947532846004714 No Seed and Plant Improvement Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization, Karaj, Iran موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی Masoumeh Pouresmael معصومه پوراسماعیل masoumehpouresmael@yahoo.com 10031947532846004715 10031947532846004715 No Seed and Plant Improvement Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization, Karaj, Iran موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی