Genetic Engineering and Biosafety Journal

fa اولین گزارش از وقوع ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه فرنگی از مزارع هندوانه شمال استان خوزستان The first report of Tomato leaf curl Palampur virus (ToLCPMV) from the watermelon fields in the north of Khouzestan province مهندسی ژنتیک میکروارگانیسم ها و ویروسها Microrganisms and Viruses پژوهشي Research <div style="text-align: justify;">ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه فرنگی (Tomato leaf curl Palampur virus, ToLCPMV) یک  Begomovirus جدید با ژنوم دوبخشی از خانواده ‌ ‌Geminiviridaeو تنها ناقل آن Bemisia tabaci میباشد. این ویروس اولین بار در سال 2008 از روی گوجهفرنگی در نواحی نیمهگرمسیری هند و سپس از پاکستان، عمان و عراق گزارش شد. به منظور شناسایی ToLCPMV در سال 1400، حدود 80 نمونه هندوانه دارای علایم ویروسی از مزارع شمال استان خوزستان (دزفول، شوش و اندیمشک) جمع آوری شد. آزمون PCR به کمک آغازگر دژنره Begomovirus (PCRv181/Bc) انجام و قطعه 550 جفت بازی مربوط به ژن Pre-coat protein روی DNA-A در نمونه های آلوده تکثیر شد. مقایسه توالی نوکلئوتیدی این ناحیه در NCBI، حضور ToLCPMV را در مناطق مورد مطالعه تأیید کرد. آزمون PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی گونه، توانست بخشی از DNA-B (ژن پروتئین حرکتی و ناحیه بین ژنی) را در 61 نمونه هندوانه تکثیر کند. ترادفهای نوکلئوتیدی تعیین شده به ترتیب و به طور میانگین 67/96-03/90 و 28/97-43/91 درصد تشابه نوکلئوتیدی و اسیدآمینهای را با دیگر توالی‌های موجود در NCBI نشان دادند. هر سه جدایه استان خوزستان بیشترین و کمترین شباهت را به جدایه های شهر جیرفت استان کرمان و جدایه های هند و پاکستان نشان دادند. ToLCPMV تاکنون از استانهای هرمزگان، کرمان، فارس، یزد و خراسان رضوی از روی گوجه فرنگی، انواع کدو، خیار، خربزه و لوبیا و نیز از روی یک نمونه هندوانه در شهرستان خاش استان سیستان و بلوچستان گزارش شده بود. در پژوهش حاضر، پراکنش و میزان خسارت ToLCPMV در برخی مناطق مانند اندیمشک بسیار زیاد بود. این اولین گزارش از وقوع گسترده ToLCPMV در مزارع هندوانه استان خوزستان میباشد.</div> <div style="text-align: justify;">Tomato leaf curl Palampur virus (ToLCPMV) is a novel Begomovirus from Geminiviridae family with a bipartite genome and Bemisia tabaci is its uniqe vector. This virus was reported on tomato in the subtropical regions of India for the first time in 2008 and then from Pakistan, Oman and Iraq. In order to identify this virus, about 80 samples of watermelon with viral symptoms were collected from watermelon fields in the north regions of Khouzestan province (Dezfoul, Shoush and Andimeshk) in 2021. PCR was performed with Begomovirus degenerate primer (PCRv181/Bc) and 550 bp fragment of pre-coat protein gene on DNA-A was amplified in the infected samples. Comparison of the nucleotide sequence of this region in NCBI confirmed the presence of ToLCPMV in the studied cities. PCR was able to amplify a part of DNA-B (a part of Movement protein gene and intergenic region) using species-specific primers in 61 watermelon samples. The determined nucleotide sequences showed an average of 90.03-96.67 and 91.43-97.28% nucleotide and amino acid identity with the other NCBI sequences, respectively. The isolates of Khouzestan province showed the most and the least similarity to the isolates of Jiroft city (Kerman province) and the isolates of India and Pakistan. ToLCPMV has been reported from Hormozgan, Kerman, Fars, Yazd and Khorasan Razavi provinces in terms of tomato, types of squash, cucumbers, melons and beans, as well as a watermelon sample in Khash city of Sistan and Balouchestan province. In the present study, the distribution and the amount of damages of ToLCPMV was too much in some areas such as Andimeshk. This is the first report of the widespread occurrence of ToLCPMV in the watermelon fields in Khouzestan province.</div> خوزستان, ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه فرنگی, هندوانه, Begomovirus Begomovirus, Khouzestan, ToLCPMV, Watermelon 72 84 http://gebsj.ir/browse.php?a_code=A-10-375-2&slc_lang=fa&sid=1 Zahra Jelavi زهرا جلوی zjelavi@gmail.com 10031947532846004724 10031947532846004724 No Department of Plant Pathology, Faculty of Agriculture and Natural Resources, Lorestan University, Khorramabad, Iran کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه لرستان، خرم‌آباد، ایران Samira Pakbaz سمیرا پاکباز samira.pakbaz@gmail.com 10031947532846004725 10031947532846004725 Yes Department of Plant Pathology, Faculty of Agriculture and Natural Resources, Lorestan University, Khorramabad, Iran. گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران Sara Gharouni Kardani سارا قارونی کاردانی saragharooni@yahoo.com 10031947532846004726 10031947532846004726 No Faculty member of Plant Protection Research Department, Khorasan Razavi Agricultural and Natural Resources Research and Education Center, (AREEO), Mashhad, Iran بخش تحقیقات گیاه‌پزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان خراسان رضوی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، مشهد، ایران Mostafa Darvish Nia مصطفی درویش نیا mdarvishnia44@yahoo.com 10031947532846004727 10031947532846004727 No Department of Plant Pathology, Faculty of Agriculture and Nature Resources, Lorestan University,Khorramabad, Iran. گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران