fa شناسایی ژن‌های حفاظت شده گیاهان گندم نان و جو با گیاه مدل آرابیدوپسیس در پاسخ به تنش شوری با استفاده از داده‌های ریزآرایه تخصصی متفرقه Divers پژوهشي Research <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:10pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" romans="" style="font-family:" times=""><b><span b="" lang="FA" style="font-family:" zar="">تنش شوری به عنوان یکی از عوامل محیطی مهم کاهش دهنده رشد و عملکرد گیاهان زراعی است. شناسایی اجزای اصلی و کلیدی درگیر در شبکه‌های پاسخ به تنش در تولید ارقام متحمل گندم و جو از طریق مهندسی ژنتیک و اصلاح مولکولی از اهمیت ویژه‌ای برخوردار است. در پژوهش اصلی حاضر به منظور شناسایی ژن‌ها و سازوکار‌های حفظ شده دخیل در پاسخ‌ به تنش شوری در گیاهان گندم،&nbsp; جو و گیاه مدل آرابیدوپسیس، داده‌های ریزآرایه مربوط به دو گونه تک لپه، گندم (دو سری داده) و جو (دو سری داده) با سطوح مختلف شوری و گیاه مدل دو لپه آرابیدوپسیس (یک سری داده) در بافت برگ تجزیه و تحلیل</span></b><b> </b><b><span b="" lang="FA" style="font-family:" zar="">شدند. این داده ها از سایت </span></b><b><span dir="LTR" new="" roman="" style="font-family:" times="">NCBI </span></b><b><span b="" lang="FA" style="font-family:" zar="">&nbsp;قسمت</span></b><b><span dir="LTR" new="" roman="" style="font-family:" times="">GEO</span></b><b><span b="" lang="FA" style="font-family:" zar=""> استخراج شدند. به منظور پیدا کردن ژن‌های مشترک پاسخ‌دهنده در سه گونه گیاهی مورد بررسی، اورتولوگ آرابیدوپسیسی ژن‌های پاسخ‌دهنده به شوری در دو گیاه گندم و جو با استفاده از </span></b><b><span dir="LTR" new="" roman="" style="font-family:" times="">BLASTx</span></b><b><span b="" lang="FA" style="font-family:" zar=""> در مقابل بانک اطلاعاتی پروتئینی آرابیدوپسیس تعیین شدند. ترسیم نمودار</span></b><b><span dir="LTR" new="" roman="" style="font-family:" times="">Venn</span></b><b><span b="" lang="FA" style="font-family:" zar=""> بین 208 ژن پاسخ‌دهنده در جو، 1336 ژن پاسخ‌دهنده در گندم و 4527 ژن پاسخ‌&zwj;&zwj;‌دهنده در آرابیدوپسیس، منجر به شناسایی 25 ژن مشترک پاسخ‌دهنده به تنش شوری شد. بررسی عملکرد ژن‌های مذکور نشان داد که این ژن‌ها به طور حفاظت شده از طریق مشارکت در مسیرهای مرتبط با سیگنال‌دهی تنش، هموستازی یونی، هموستازی گونه‌های اکسیژن فعال، حفاظت اسمزی، هموستازی انرژی و لیگینی شدن در پاسخ سه گیاه مورد مطالعه به تنش شوری نقش دارند. مدل پیشنهادی نشان‌دهنده نحوه مداخله ژن‌های مذکور در مسیرهای پاسخ به تنش ارائه شد.</span></b></span></span></span></span><br> &nbsp;</div> <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:10pt"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" romans="" style="font-family:" times=""><span style="font-size:12.0pt">Salt stress is one of the important environmental factors that adversely affects plant growth and yield. Identification of key components involved in the stress response networks is the important task in development of tolerant varieties through genetic engineering and molecular breeding programs. Here, we have performed comprehensive bioinformatics analysis to identify conserved genes and mechanisms involving in salt stress response across monocots, wheat and barley and dicot <i>Arabidopsis</i>. The microarray data were retrieved from GEO dataset at NCBI, which were already generated through experiments on the leaves of mentioned species under various stress conditions. Arabidopsis orthologues of salt responsive genes from wheat and barley were recognized by performing BLASTx compared with Arabidopsis protein database. We identified 208, 1336, and 4527 salt responsive genes from barley, wheat, and Arabidopsis, respectively, where 25 genes were common and considered as conserved salt responsive genes among species. The conserved genes are involved in stress signaling, ion homeostasis of ions, reactive oxygen species homeostasis, and energy, osmoprotectant mechanisms, and cell wall lignification pathways by exposing to salt stress in the three species. The theoretical gene co-expression network during signaling pathway was also presented in the salt stress condition.</span></span></span></span><br> &nbsp;</div> تنش شوری, ژن‌های حفاظت شده,ریزآرایه, تک لپه, دولپه salt stress, microarray, conserved genes, monocot, dicot 95 109 http://gebsj.ir/browse.php?a_code=A-10-461-1&slc_lang=fa&sid=1 Ramin Khodadadi رامین خدادادی raminkhodadadi73@gmail.com 10031947532846005228 0009-0001-5236-5955 No Biology Dept, Islamic Azad University of Zanjan دانشکده علوم زیستی دانشگاه آزاد اسلامی واحد زنجان Nazanin Amirbakhtiar نازنین امیر بختیار nabakhtiar@spii.ir 10031947532846005229 10031947532846005229 No National Plant GeneBank of Iran, Seed and Plant Improvement Institute, Agricultural Research, Education, and Extension Organization (AREEO) بانک ژن ملی گیاهی ایران، موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی Behzad Sorkhilalehloo بهزاد سرخی لله لو bsorkhi@gmail.com 10031947532846005230 10031947532846005230 No National Plant GeneBank of Iran, Seed and Plant Improvement Institute, Agricultural Research, Education, and Extension Organization (AREEO) بانک ژن ملی گیاهی ایران، موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی Masood Soltani Najafabadi مسعود سلطانی نجف آبادی m.soltanioil@yahoo.com 10031947532846005231 10031947532846005231 Yes National Plant GeneBank of Iran, Seed and Plant Improvement Institute, Agricultural Research, Education, and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran بانک ژن ملی گیاهی ایران، موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران