fa شناسایی، همسانه سازی وتعیین توالی ژن MT ND2 در مرغ‌های بومی خراسان مهندسی ژنتیک جانوری Animal پژوهشي Research <p dir="RTL"></p> <p><strong><span dir="RTL">میتوکندری مسئول تولید 90 درصد از انرژی مورد نیاز سلول می باشد. مقداری از تفاوت‌ها در عملکرد رشد جوجه‌های گوشتی و بیان فنوتیپی راندمان غذایی ممکن است مربوط به اختلاف در راندمان عملکرد میتوکندری باشد. </span><span dir="RTL">این پژوهش بمنظور همسانه سازی و تحلیل مرغان بومی خراسان با تاکید بر ژن </span>ND2<span dir="RTL">&nbsp; به منظور بررسی جهش&shy;های احتمالی است. بدین منظور از نمونه خون مرغ بومی خراسان، </span>DNA<span dir="RTL"> ژنومی استخراج گردید</span> <span dir="RTL">و</span> <span dir="RTL">با استفاده از آغازگرهای اختصاصی این ژن، واکنش زنجیره&shy;ای پلیمراز جهت تکثیر ژن انجام شد، محصول واکنش بر روی ژل آگارز الکتروفورز شد. باندهای حاصل با استفاده از ناقل خطی </span>pTZ57R/T<span dir="RTL"> در باکتری </span><em>E. coli</em><span dir="RTL"> همسانه&shy; سازی و توالی&shy; یابی شد. مقایسه نوکلئوتیدی قطعه توالی&shy; یابی شده با ژنوم مرجع چهار جهش را نشان داد و </span><span dir="RTL">شباهت 99% در 100% طول خود با توالی کامل ژنوم میتوکندری </span><em>Gallus gallus</em><span dir="RTL"> در توالی&shy;های ثبت شده میتوکندری طیور با شماره دسترسی </span>X52392.1<span dir="RTL"> (ژنوم مرجع)، </span>GU261709.1<span dir="RTL">، </span>GU261712.1<span dir="RTL">، </span>AP006746.1<span dir="RTL">، </span>KF826490.1<span dir="RTL">، </span>HQ857210.1<span dir="RTL"> و </span>AY235571.1<span dir="RTL"> نشان داد. مقایسه پروتئینی نشان دهنده شباهت توالی حاصل با توالی‌های پروتئینی مربوط به ژن </span>ND2<span dir="RTL"> میتوکندری طیور در بانک اطلاعاتی بود به گونه ای که بیشترین شباهت، 100% در 100% طول خود متعلق به ژن </span>ND2<span dir="RTL"> در </span><em>Gallus gallus</em><span dir="RTL">&nbsp; با شماره دسترسی </span>BAC57576.1<span dir="RTL"> و کمترین شباهت متعلق به جنس ها و گونه های&nbsp; </span><em>Chrysolophus amherstiae</em><span dir="RTL"> با شماره دسترسی&nbsp; </span>AAF65702.1 <span dir="RTL">و </span><em>Tetrastes sewerzowi</em><span dir="RTL"> با شماره دسترسی </span>ABH01111.1<span dir="RTL"> با 80% شباهت در 100% طول خود بود. همچنین توالی اسیدآمینه‌ای مرغ بومی خراسان با توالی مرجع و سایر توالی‌ها با شماره مرجع </span>YP272073.1<span dir="RTL">، </span>BAD11115.1<span dir="RTL">، </span>NP_006916.1<span dir="RTL">، </span>ADB06584.1<span dir="RTL"> و </span>ADW41566.1<span dir="RTL"> شباهت 99% در 100% طول نشان داد. پس از تبدیل توالی نوکلئوتیدی بدست آمده به توالی </span><span dir="RTL">اسیدآمینه‌ای، با توالی پروتئینی مرجع مقایسه شد. نتیجه این مقایسه تفاوت در یک اسیدآمینه را نشان داد. در اسیدآمینه 130 لوسین که اسیدآمینه ای غیرقطبی است به اسیدآمینه غیرقطبی متیونین تبدیل شد. جهش‌های مشاهده شده در این تحقیق از آنجایی که منجر به تغییر اسید آمینه شده است می‌توان به عنوان یک پایه در بررسی‌های اختلالات سوخت وساز و صفات تحت تاثیر ژن </span>MT-DNA<span dir="RTL"> در مطالعات بعدی قرار گیرد</span></strong></p> <p>discovering the sequences of mitochondrion has made it possible to study the presence of controlling genes in this organelle. Mitochondrion is responsible for producing 90 percent of the energy that the cell needs. Some differences in the broiler chicken growing function and the resulting phenotype and food efficiency may be related to differences in mitochondrion function. The aim of this study was to clone and to analyze the ND2 gene among Khorasan&rsquo;s native chickens in order to investigate possible mutations. To this end, genomic DNA was extracted from blood sample taken from this population. Then, using ND2 specific primers, PCR was conducted in order to multiply this gene. The PCR product was cloned into pTZ57R/T linear vector and sequenced. Comparison between the sequenced fragments and the registered gene revealed four mutations. A similarity of 99% was observed between them and the complete mitochondrial genome sequence of <em>Gallus gallus</em> with the accession numbers of X52392.1 (reference), GU261709.1, GU262712.1, AP006746.1, KF826490.1, HQ857210.1, and AY23557.1. Comparison between proteins showed that the resulting sequence was similar to protein sequences related to mitochondrial ND2 gene of the poultry in the data bank. The maximum similarity (100% similarity) was with the ND2 gene in <em>Gallus gallus</em> with the accession number of BAC57576.1. The minimum similarity (88% similarity) was with the ND2 gene in <em>Chrysolophus amherstiae</em> with the accession number of AAF65702.1 and <em>Tetra stessewerzowi</em> with the accession number of ABH01111.1. Also, the amino acid sequences of Khorasan&rsquo;s native chicken had 99% similarity with reference sequence and other sequences with the accession numbers of YP272073.1, BAD11115.1, NP_006916.1, ADB06584.1, and ADW41566.1. After translating the obtained nucleotide sequence to the amino acid sequence, it was compared with the reference proteins sequence. The result of this comparison showed a difference in one amino acid. The amino acid Leucine 130 was changed to Methionine.</p> همسانه سازی تعیین توالی MT ND2 مرغان بومی خراسان Chickens- Mitochondrial Genes- Cloning- MT-ND2 113 106 http://gebsj.ir/browse.php?a_code=A-10-99-1&slc_lang=fa&sid=1 Hamid Reza Izadnia حمیدرضا ایزدنیا izadnia1@gmail.com 10031947532846001576 10031947532846001576 No Ferdowsi University of Mashhad , International Campus دانشگاه فردوسی مشهد Mojtaba Tahmoorespur مجتبی طهمورث پوز m_tahmoorespur@yahoo.com 10031947532846001577 10031947532846001577 Yes Ferdowsi University of Mashhad دانشگاه فردوسی مشهد Mohammad Reza Nassiry محمدرضا نصیری nassiryr@gmail.com 10031947532846001578 10031947532846001578 No Ferdowsi University of Mashhad دانشگاه فردوسی مشهد