[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 10، شماره 1 - ( 5-1400 ) ::
جلد 10 شماره 1 صفحات 46-23 برگشت به فهرست نسخه ها
شناسایی خانواده ژنی ABC-Transporter و آنالیز الگوی همزمانی شبکه بیان ژنی در مراحل مختلف نموی استولون سیب زمینی در پاسخ به تنش‌های خشکی و شوری
بهاره پورفرید، کریم سرخه*، پدرو مارتینز گومز
گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز ایران ، k.sorkheh@scu.ac.ir
چکیده:   (1140 مشاهده)
ژنهایABC transporter (ATP-binding Cassette)  یکی از بزرگ­ترین خانواده­های ژنی هستند که در سه قلمرو باکتریها، یوباکتریها و یوکاریوت­ها یافت می­شوند. بیشتر پروتئین‌های شناخته شدهABC ، وابسته به ATP بوده و ناقلین غشایی قادر به جابجایی و انتقال محدوده وسیعی از مولکول‌های درون و بیرون غشای سلولی­ اند. این ناقلین در فرآیندهای زیستی متنوعی نقش مهمی دارند. از آنجا که تاکنون مطالعه جامعی در رابطه با شناساییABC transporterها در گیاه سیب­ زمینی انجام نشده است، در این تحقیق با جستجو در پایگاه اطلاعاتی NCBI  و غربالگری ژن­های شناسایی شده، در نهایت 228 ژن ABC transporter شناسایی شد. تجزیه و تحلیل هستی­ شناسی(GO)  نشان داد که حدود %53 ازABC transporter ها در فرآیندهای بیولوژیکی وظیفه انتقال و جابجایی مواد را برعهده دارند. همچنین، تجزیه و تحلیل عملکرد مولکولی و محتوای سلولی نشان داد به ترتیب %32 به عنوان ATP-binding و%43 از آنها جزء عملگرهای غشاهای درونی هستند. همچنین بررسی عناصر Cis در پروموتور ژن­های ABC transporter انجام گرفت که در نهایت 13عنصر در تنش خشکی و 3 عنصر در تنش شوری مشخص گردید. درنهایت الگوی بیانی 8 ژنABC transporter انتخاب شده تحت تنش­های خشکی و شوری با استفاده از روش  qPCRمورد تائید و بررسی قرار گرفت. نتایج بررسی­ها نشان داد، ژن­های مورد مطالعه تحت تاثیر تنش­ها بودند. ژن­­­های StABC-050،StABC-084  و StABC-124 در تنش خشکی و نیز ژن­های StABC-084  و StABC-001در برابر تنش شوری دارای افزایش بیان بودند. در ادامه جهت اطمینان از اعمال تنش­های وارد شده، میزان پرولین و RWC و نیز سدیم-پتاسیم اندازه ­گیری شد. طبق نتایج به دست آمده با افزایش تنش خشکی، مقدار پرولین در مراحل نموی مختلف روند افزایشی و رطوبت نسبی دارای روند کاهشی بود به طوری که این کاهش در میزان RWC با کنترل، در سطح %1 اختلاف معنی­داری را نشان داد. هدف از این تحقیق، شناسایی بیوانفورماتیکی و بررسی الگوی بیان ژن­های انتخابی ABC transporter تحت تنش خشکی و شوری در سیب زمینی بود.
 
واژه‌های کلیدی: بیان ژن، بیوانفورماتیک، تنش های غیرزیستی، استولون سیب زمینی، ATP-binding cassette (ABC) transporter
متن کامل [PDF 2368 kb]   (285 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: مهندسی ژنتیک گیاهی
دریافت: 1399/12/17 | پذیرش: 1400/3/14 | انتشار: 1400/6/10
ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Pourfarid B, Sorkheh K, Martinez-Gomez P. Identification of ABC-Transporter gene family and analysis of gene co-expression network pattern in different stages of potato stolone development in response to drought and salinity stress. Genetic Engineering and Biosafety Journal. 2021; 10 (1) :23-46
URL: http://gebsj.ir/article-1-371-fa.html

پورفرید بهاره، سرخه کریم، مارتینز گومز پدرو. شناسایی خانواده ژنی ABC-Transporter و آنالیز الگوی همزمانی شبکه بیان ژنی در مراحل مختلف نموی استولون سیب زمینی در پاسخ به تنش‌های خشکی و شوری. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1400; 10 (1) :46-23

URL: http://gebsj.ir/article-1-371-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 10، شماره 1 - ( 5-1400 ) برگشت به فهرست نسخه ها
دوفصل نامه علمی-پژوهشی مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی Genetic Engineering and Biosafety Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.06 seconds with 29 queries by YEKTAWEB 4447