گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه بین‌المللی امام خمینی، قزوین، ایران ، nayeri@eng.ikiu.ac.ir
چکیده: (2522 مشاهده)
بیماریهای تنفسی و التهاب ریوی از شایعترین بیماریهایی است که بیش از 50 درصد مردم جهان را درگیر میکند. تاکنون داروهای مختلفی در زمینه پیشگیری و درمان این بیماریها توسعه یافته است. پپتید rT1، متعلق به گیاه دارویی چای ترش با طول 27 اسیدآمینه دارای خاصیت مهارکنندگی نوتروفیل الاستاز انسانی و پتانسیل بالقوه دارویی در زمینه پیشگیری و درمان بیماریهای التهابی ریه است. باتوجه به ارزش اقتصادی بالای ترکیبات با خاصیت مهارکنندگی نوتروفیل الاستاز، در این پژوهش برای اولین بار با هدف بیان این پپتید در گیاهان، همسانه سازی و ساخت وکتور بیانی نوترکیب pBI121-rT1 انجام شد. باتوجه به نبودن توالی ژنی این پپتید در پایگاه های داده، ابتدا توالی ژنی مناسب آن براساس ترجیح کدونی گیاه توتون، وکتورهای بکار برده شده در پژوهش، ساختار و پایداری رونوشت حاصل از آن و خصوصیات پروتئین تولید شده از آن طراحی و سنتز شد. شاخص سازگاری کدونی برای توالی طراحی شده برابر با 92/0 و فراوانی GC 32/42 درصد محاسبه شد. پایداری پپتید طراحی شده در سلولهای انسانی نسبت به پپتید اصلی 25 برابر افزایش یافت و شاخص ناپایداری برای پپتید طراحی شده برابر 90/20 محاسبه شد. به منظور همسانه سازی، توالی سنتز شده به وسیله واکنش PCR تکثیر و در وکتور pMCS5 همسانهسازی شد. سپس با هدف بیان این پپتید در گیاهان، زیرهمسانه سازی توالی طراحی شده، در وکتور بیانی pBI121 تحت پروموترCaMV 35S انجام شد.
Sahandi Khalifeh-Kandy A, Dehghan Nayeri F. Bioinformatics design and cloning of Hibiscus sabdariffa rT1 gene for construction of pBI121-rT1 recombinant vector in order to expression in plants. Genetic Engineering and Biosafety Journal 2021; 10 (1) :47-57 URL: http://gebsj.ir/article-1-370-fa.html
سهندی خلیفه کندی امین، دهقان نیری فاطمه. طراحی بیوانفورماتیکی و همسانه سازی ژن rT1 چای ترش برای ساخت وکتور نوترکیب pBI121-rT1 به منظور بیان در گیاهان. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1400; 10 (1) :47-57
