عفونت بوسیله باکتریوفاژها یکی از چالشهای مهم کاربرد باکتریهای مختلف در صنایع میباشد. یکی از سیستمهای ضد ویروسی ذاتی در باکتریها سیستم CRISPR/Cas میباشد و تعیین ویژگی این سیستمها در باکتریها میتواند در فرمولاسیون و بکارگیری این باکتریها نقش کمک کنندهای داشته باشد. بر این اساس و به منظور شناسایی سیستم CRISPR/Cas در باکتریهای جنس لوکونوستوک، توالی ژنوم کامل ۱۸ گونه شناسایی شدهی این جنس مورد کاوش قرار گرفت و اطلاعات سیستم CRISPR/Cas آنها بر اساس الگوریتمهای مبتنی بر همولوژی بررسی گردید. در مرحله بعد ویژگیهای مربوط به ساختارهای کونفورماسیونی و پایداری سیستمهای شناسایی شده بر اساس انرژی آزاد تعیین، جایگاه شناسایی فاژها (PAM) با استفاده از رویکردهای مبتنی بر BLAST شناسایی، و در نهایت روابط خویشاوندی این سیستمها بر اساس توالی آمینواسیدی پروتئینهای همراه مورد ارزیابی قرار گرفت. بر اساس نتایج بدست آمده از مجموع ۱۸ گونه ثبت شده برای این جنس در NCBI، ۹ گونه دارای سیستم CRISPR/Cas کامل بودند. نتایج مربوط به تعیین نوع سیستم CRISPR/Cas ، نشان داد که غیر از یک مورد، همه سویهها حاوی سیستم نوع II-A میباشند. تعداد توالیهای تکراری در این سیستمها بین ۴ تا ۱۰۱ عدد و طول متوسط توالیهای فاصله دهنده بین ۲۸ تا ۳۰ نوکلوئوتید متغییر بودند. در مجموع ۹ نوع توالی PAM در انتهای ´۳ و ۹ نوع توالی PAM در انتهای ´۵ این سیستمها شناسایی شد. بر اساس نتایج آنالیز خویشاوندی، این سیستمها در دو گروه اصلی تقسیمبندی شدند. به نظر میرسد سیستم CRISPR/Cas نوع II-A فعالترین سیستم بر علیه DNA مهاجم خارجی و عفونتهای باکتریوفاژی در باکتریهای جنس لوکونوستوک باشد.
