fa همسانه‌سازی، مطالعه بیوانفورماتیکی و بررسی بیان ژن سکوالن ‌سینتاز1 در شیرین‌بیان بومی ایران مهندسی ژنتیک گیاهی Plant پژوهشي Research <strong><span style="font-family:b zar;">شیرین‌بیان (</span></strong><strong><em><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">Glycyrrhiza glabra</span></span></em></strong><strong><span style="font-family:b zar;">)، یکی از مهم&shy;ترین گیاهان دارویی است که دارای ترکیبات فعال زیستی مانند ساپونین تری‌ترپنوئیدها (گلیسیریزین) و فیتواسترول‌ها است. سکوالن سینتاز (</span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">Squalene Synthase</span></span></strong><strong><span style="font-family:b zar;">)، آنزیم (</span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">EC 2.5.1.21</span></span></strong><strong><span style="font-family:b zar;">) متصل به غشا است که دو مولکول فارنسیل دی&shy;‌فسفات را به سکوالن تبدیل می‌کند. سکوالن پیش ماده اصلی بیوسنتز تری‌ترپن‌ها و استرول‌ها است. در این مطالعه توالی بیان کننده سکوالن ‌سینتاز 1 شیرین‌بیان بومی ایران در وکتور </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">pTZ57R/T</span></span></strong><strong><span style="font-family:b zar;"> همسانه‌سازی و ویژگی‌های بیوانفورماتیکی پلی&shy;‌پپتید با استفاده از نرم‌افزارها پیش‌بینی شد. </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">cDNA</span></span></strong><strong><span style="font-family:b zar;"> سکوالن ‌سینتاز 1، 1242 جفت باز دارد و یک پلی‌پپتید 413 آمینواسیدی را بیان می‌کند. بررسی‌های بیوانفورماتیکی نشان داد که پلی&shy;‌پپتید سکوالن سینتاز 1 شیرین‌بیان، بیشترین شباهت را با سکوالن ‌سینتاز 1 جنس </span></strong><strong><em><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">Glycyrrhiza</span></span></em></strong><strong><span style="font-family:b zar;"> دارد. بررسی جایگاه درون&shy; سلولی نشان داد که فعالیت پروتئین در ارتباط با شبکه آندوپلاسمی است. وزن مولکولی پروتئین 3/47 کیلودالتون و نقطه ایزوالکتریک آن 18/8 است. در توالی آمینواسیدی دو ناحیه فراغشایی و دو بخش حفاظت &shy;شده مشخص شد. ساختار سه&shy; بعدی پروتئین با استفاده از نرم‌افزار </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">I-TASSER</span></span></strong><strong><span style="font-family:b zar;"> پیشگویی شد. در ساختار پروتئین پیشگویی شده، مارپیچ فراغشایی، آمینواسیدهای آب&shy;گریز، توالی حفاظت شده و آمینواسیدهای سطح پروتئین با نرم‌افزار </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">Chimera</span></span></strong><strong><span style="font-family:b zar;"> مشخص شد. الگوی بیان ژن سکوالن ‌سینتاز 1 نشان داد که بیشترین و کمترین بیان به‌ترتیب مربوط به ریشه و اندام سبز گیاه است.</span></strong><br> &nbsp; Licorice (<em>Glycyrrhiza glabra</em> L.) is one of the most important medicinal plants and contains bioactive compounds such as triterpene saponins (glycyrrhizin) and phytosterols. Squalene synthase (EC 2.5.1.21) is a membrane- bound enzyme that converts two farnesyl diphosphate molecules into squalene, a key precursor for sterol and triterpene biosynthesis. In this study, the coding sequence of squalene synthase 1 in Iranian native licorice was cloned in pTZ57R/T and the characterization of its polypeptide was predicted by using bioinformatic tools. The cDNA of <em>GgSQS1</em> is 1242bp and encodes a 413 amino acid polypeptide. Bioinformatic analysis revealed that the deduced <em>GgSQS1</em> polypeptide had high similarity with squalene synthase1 of members of the <em>glycyrrhiza</em> genus. Subcellular analysis showed that the activity of this polypeptide is in the endoplasmic reticulum. The molecular weight of this polypeptide is 47.3 kDa with a pI value of 8.18. Two transmembrane domains and two protected regions were detected in the amino acid sequence. The three-dimensional protein structure was predicted using I-TASSER software. In the predicted structure, transmembrane helixes, hydrophobic amino acids, the conserved sequence and amino acids on the protein surface were identified using Chimera software. Studies of Squalene synthases1 gene expression showed that the highest and lowest expression occur in the root and green organs of the plant, respectively.<br> &nbsp; ترپنوئید, RT-PCR کمی, فیتواسترول, گلیسیریزین, همسانه سازی cDNA cDNA cloning, Glycyrrhizin, Phytosterol, qRT-PCR, Terpenoid 37 48 http://gebsj.ir/browse.php?a_code=A-10-88-2&slc_lang=fa&sid=1 Zahra Shirazi زهرا شیرازی zshirazi85@yahoo.com 10031947532846002221 10031947532846002221 No Department of Biotechnology, Faculty of Agricultural Sciences, University of Guilan, Iran گروه بیوتکنولوژی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، ایران Ali Aalami علی اعلمی ali_aalami@yahoo.com 10031947532846002222 10031947532846002222 Yes Department of Biotechnology, Faculty of Agricultural Sciences, University of Guilan, Iran گروه بیوتکنولوژی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، ایران Masoud Tohidfar مسعود توحیدفر m_tohidfar@sbu.ac.ir 10031947532846002223 10031947532846002223 No Biotechnology Department, Faculty of Science and Biotechnology, Shahid Beheshti University, Tehran, Iran گروه بیوتکنولوژی، دانشکده علوم و زیست فناوری، دانشگاه شهید بهشتی، ایران Mohammad Mehdi Sohani محمد مهدی سوهانی msohani@guilan.ac.ir 10031947532846002224 10031947532846002224 No Department of Biotechnology, Faculty of Agricultural Sciences, University of Guilan, Iran گروه بیوتکنولوژی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، ایران