fa مطالعه in silico خانواده ژنی پلی‌آمین اکسیداز (PAO) در انگور تخصصی متفرقه Divers پژوهشي Research <strong><span style="font-family:b zar;">پلی&shy; آمین اکسیدازها (</span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">PAO</span></span></strong><strong><span style="font-family:b zar;">) آنزیم&shy;های وابسته به فلاوین آدنین دی&shy;نوکلئوتید هستند که در کاتابولیسم پلی&shy;آمین&shy;ها در پراکسی&shy; زوم، آپوپلاست و سیتوپلاسم نقش دارند. گزارش&shy;های زیادی در زمینه اهمیت ژن&shy;های </span></strong><strong><em><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">PAO</span></span></em></strong><strong><span style="font-family:b zar;"> گیاهان در پاسخ به تنش&shy;ها ارائه شده است با این حال مطالعه جامعی در مورد تعداد، روابط تکاملی، ساختار ژنی و الگوی بیانی ژن&shy;های </span></strong><strong><em><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">PAO</span></span></em></strong><strong><span style="font-family:b zar;"> در انگور موجود نیست. در مطالعه حاضر با استفاده از روش&shy;های بیوانفورماتیکی، هشت ژن محتمل </span></strong><strong><em><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">PAO</span></span></em></strong><strong><span style="font-family:b zar;"> (</span></strong><strong><em><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">VvPAO1</span></span></em></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">-<em>VvPAO8</em></span></span></strong><strong><span style="font-family:b zar;">) در ژنوم انگور </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">12X</span></span></strong><strong><span style="font-family:b zar;"> شناسایی شد. بر اساس مطالعه فیلوژنتیکی ژن&shy;های </span></strong><strong><em><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">VvPAO</span></span></em></strong><strong><span style="font-family:b zar;"> به سه گروه تقسیم می&shy;شوند که هر گروه از نظر جایگاه سلولی و کارکرد اختصاصی است. ژن&shy;های </span></strong><strong><em><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">VvPAO</span></span></em></strong><strong><span style="font-family:b zar;"> دارای صفر تا 9 اینترون می‌باشند و بر روی 6 کروموزوم از 19 کروموزوم انگور قرار گرفته &shy;اند. وجود چندین عنصر تنظیمی </span></strong><strong><em><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">cis</span></span></em></strong><strong><span style="font-family:b zar;"> پاسخ به تنش&shy;ها و هورمون&shy;ها در پیشبر این ژن&shy;ها دلالت بر نقش احتمالی آن&shy;ها در پاسخ به تنش&shy;ها دارد. بررسی داده&shy; های ریزآرایه ژن&shy;های اورتولوگ </span></strong><strong><em><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">PAO</span></span></em></strong><strong><span style="font-family:b zar;"> انگور در آرابیدوپسیس در شرایط تنش&shy;های غیر زیستی نشان داد که سطح رونویسی این ژن&shy;ها در پاسخ به تنش&shy;های غیر زیستی افزایش می&shy;یابد که نشان دهنده نقش این ژن&shy;ها در پاسخ انگور به تنش&shy;ها است. نتایج این مطالعه داد&shy;های پایه برای پژوهش&shy;های بیشتر در مورد نقش ژن&shy;های </span></strong><strong><em><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">PAO</span></span></em></strong><strong><span style="font-family:b zar;"> در انگور را فراهم می&shy;سازد.</span></strong><br> &nbsp; <p>Growth, development and productivity of plants are greatly affected by various abiotic stresses. Physiological and molecular studies have shown that naturally occurring plant polyamines (PAs) are involved in conferring abiotic stress tolerance in plants. Polyamine oxidases (PAOs) are FAD-dependent enzymes associated with polyamine catabolism in peroxisomes, the apoplast and the cytoplasm. In plants, increasing evidence supports the idea that <em>PAO</em> genes play essential roles in abiotic and biotic stresses responses. In this study, &nbsp;bioinformatic analysis identified eight putative <em>PAO</em> genes (<em>VvPAO1&ndash;VvPAO8</em>) in grape (<em>Vitis vinifera</em>) using the released 12&times;assemble grape genomic sequences. Phylogenetic analysis indicates that these <em>VvPAOs</em> can be classified into three subgroups as found in <em>Arabidopsis</em> and rice and also reveal that grape PAO proteins are more closely related to <em>Arabidopsis</em> than to those in rice. The <em>VvPAO</em> genes contained zero to nine introns and were distributed across 6 out of the 19 chromosomes in grape. Promoter analysis showed the presence of several cis-regulatory elements related to stress and hormone responses in regulatory regions, indicating their probable role in stress response. Microarray-based expression analysis of <em>VvPAO</em> orthologs in <em>Arabidopsis</em> under abiotic stresses showed that transcript levels of <em>PAO</em> genes were up-regulated significantly by such treatments, indicating their vital roles during stress adaptation. The results obtained provide basic information for future research on the functions of <em>PAO</em> genes in grape.</p> بررسی فیلوژنتیکی, بیان ژن, بیوانفورماتیک, پلی آمین, تنش غیر زیستی Abiotic Stress, Bioinformatics, Gene Expression, Phylogenetic Analysis, Polyamine 49 63 http://gebsj.ir/browse.php?a_code=A-10-210-1&slc_lang=fa&sid=1 Amin Abedi امین عابدی abedi.amin@yahoo.com 10031947532846001431 10031947532846001431 No Department of Agricultural Biotechnology, Faculty of Agriculture Science, University of Guilan, Rasht, Iran گروه بیوتکنولوژی کشاورزی دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران Mohammad Mehdi Sohani محمد مهدی سوهانی msohani@guilan.ac.ir 10031947532846001432 10031947532846001432 Yes Department of Agricultural Biotechnology, Faculty of Agriculture Science, University of Guilan, Rasht, Iran گروه بیوتکنولوژی کشاورزی دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران Reza Shirzadian-Khoramabad رضا شیرزادیان خرم آباد r.shirzadian@guilan.ac.ir 10031947532846001433 10031947532846001433 No Department of Agricultural Biotechnology, Faculty of Agriculture Science, University of Guilan, Rasht, Iran گروه بیوتکنولوژی کشاورزی دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران