fa تجزیه بیوانفورماتیکی ESTهای جداسازی شده از گیاه Aeluropus littoralis تحت تنش شوری مهندسی ژنتیک جانوری Animal پژوهشي Research <p>کاربرد بیوتکنولوژی در اصلاح گیاهان زراعی نیاز به منابع ژنتیکی برای تحمل به شوری و پایداری عملکرد دارد. گیاه آلوروپوس لیتورالیس (Aeluropus littoralis) مدل مناسبی برای پژوهش‌های ژنتیکی و درک مولکولی ساز و کارهای تحمل به شوری در تک لپه‌ای‌ها است. به خصوص این‌که درصد بالای همولوژی با ژن‌های برنج دارد. در این بررسی 150 EST که تحت تنش شوری از گیاه آلوروپوس لیتورالیس جداسازی شده بود را از بانک‌های اطلاعاتی دریافت و بعد از حذف توالی‌های تکراری، عملکرد احتمالی و شباهت آن‌ها با داده‌های موجود در بانک داده‌ها بررسی شد. نتایج نشان داد که 71 EST با توالی‌های پروتئینی موجود در بانک داده‌ها شباهت داشت و عملکرد آن‌ها نیز مشخص شد درحالی‌که 14 EST با داده‌های موجود در بانک داده‌ها شباهت داشت اما عملکرد آن‌ها در بانک داده‌ها مشخص نبود و همچنین 7 EST نیز با هیچکدام از پروتئین‌های موجود در بانک داده‌ها شباهت نداشته و عملکرد آن‌ها ناشناخته باقی ماند. نتایج هم‌ردیفی ESTهای بررسی شده از نظر عملکردی نشان داد که ESTهای ایزوله شده، در 19 گروه مختلف قرارگرفتند. 16 EST در انتقال مواد (از گروه ژن‌های ترانسپورتر) در گیاه فعالیت داشته، 13 ESTها در گروه پروتئین‌های ریبوزومی بوده که در ساختار ریبوزوم و عمل ترجمه دخالت دارند. سایر ESTها نیز در فعالیت‌هایی از قبیل تنظیم فعالیت کانال‌های سلولی، ویرایش آر.ان.اِ و تقسیم سلولی دخیل هستند. در مجموع نتایج پژوهش نشان داد که با توجه به درصد بالای همولوژی آلوروپوس لیتورالیس با ژن‌های برنج در مقایسه با سایر گیاهان، مهندسی ژنتیک در این گیاه می‌تواند به تعیین تفاوت تحمل به شوری بین گیاهان گلایکوفیت و هالوفیت کمک کند.</p> <p>biotechnology needs the genetic resources to establish the sustainable tolerance to salinity stress in GMO plants. <em>Aleluropus littoralis</em> is known as a good model plant for understanding the genetic and molecular mechanism of salt resistance in monocots. This plant has a high genetical homology with rice. In this study, 150 ESTs were isolated from <em>A.</em> <em>littoralis</em>. Firstly, repeated sequences were eliminated and then the possible function and similarity of the remained ESTs were compared with other ESTs of different plants using international genetic databases. Results of this study showed that, 71 of the selected ESTs were similar to the ESTs in the databases and their function have been determined. Moreover, 14 ESTs were similar to the ESTs in the databases but their functions have not been determined yet. Seven ESTs did not show any similarity. Alignment analysis showed that the isolated ESTs were categorized in 19 different groups. 16 ESTs acted as a transporter, 12 ribosomal proteins and the other ESTs were related to channel transfer regulators, RNA editing and cell division. By the relatively high level of homology with rice genes, the genetic studies on <em>Aleuropus</em> could help in determining the differences in salt-tolerance between glycophyte and halophyte grass</p> آلوروپوس‌لیتورالیس بانک داده‌ها بیوانفورماتیک تنش شوری EST Aeluropus littoralis, Databank, Bioinformatics, Salinity stress and EST. 31 40 http://gebsj.ir/browse.php?a_code=A-10-88-3&slc_lang=fa&sid=1 Amin Ebrahimi امین ابراهیمی 10031947532846001595 10031947532846001595 No , University College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran. پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران Reza Maali amiri رضا معالی امیری 10031947532846001596 10031947532846001596 Yes , University College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran. پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران Gorban ali Nematzadeh قربانعلی نعمت زاده 10031947532846001597 10031947532846001597 No Sari University of Agriculture science and Natural Resources, Genetics and Agricultural Biotechnology Institute of Tabarestan (GABIT), Sari, Iran. دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، ساری Hoshang Alizade هوشنگ علیزاده 10031947532846001598 10031947532846001598 No , University College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran. پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران