Genetic Engineering and Biosafety Journal

fa شناسایی in silico خانواده ژنی PLD و بررسی الگوی بیان آنها در پاسخ به تنش شوری در گیاه Medicago truncatula In silico identification of the PLD gene family and analysis of their expression pattern in response to salt stress in Medicago truncatula تخصصی متفرقه Divers پژوهشي Research فسفولیپاز  D (PLD) و اسید فسفاتیک حاصل از آن نقش مهمی در تنظیم فرآیندهای سلولی از جمله رشد و نمو و پاسخ به تنش دارد. PLDها یک خانواده ژنی مهم را در گیاهان عالی تشکیل میدهند. که در آرابیدوپسیس، برنج و پنبه شناسایی شدهاند. در این پژوهش 16 ژن PLD در گیاه Medicago truncatula L. شناسایی شد که براساس دمینهای پروتئینی، روابط فیلوژنی، ساختار ژن و شباهت توالی به 6 گروه α (4 ژن)، β (2 ژن)، γ (2 ژن)، δ (3 ژن)، ε (2 ژن)، ζ (2 ژن) و φ (1 ژن) تقسیم شد. الگوی بیان ژنهای MtPLD4 و MtPLD9 در زیرگروه α و ژنهای MtPLD13 و MtPLD15 در زیر گروه β/ γ تحت تنش شوریNaCl  با غلظت ds/m 23 در گیاهچههای چهار هفتهای M. truncatula L. با استفاده از qRT-PCR بررسی شد. بیان MtPLD4 در طی 48 ساعت نسبت به گیاه شاهد به طور معنی داری افزایش داشت. الگوی بیان MtPLD9 و MtPLD15 در ساعات اولیه روند افزایشی و سپس نسبت به گیاه شاهد کاهش بیان داشت. بیان MtPLD13 در طی 48 ساعت کاملا روند کاهشی داشته و سرکوب شد. این نتایج نشان داد که زیرگروه α ژنهای MtPLD کاندیدای مهم و با ارزشی جهت آزمون‌های بعدی و مطالعات ژنومیکس کارکردی است.   Phospholipase D (PLD) and its product phosphatidic acid play important roles in cellular processes in plants including growth and developmentand stress responses. PLD genes constitute an important gene family in higher plants. The PLD family has been identified in Arabidopsis, rice, cotten and grape. In this study, 16 PLD genes were identified in the Medicago truncatula L. on the basis of protein domains, evolutionary relationship, gene architecture and sequence identity. They were grouped into six clads; α (4 genes), β (2 genes), γ (2 genes), δ (3 genes), ε (2 genes), ζ (2 gene) and φ (1 gene). The gene expression pattern of MtPLD4, MtPLD9 in the α subgroup and MtPLD13, MtPLD15 in the β/γ subgroup were investigated in four-week-old seedlings of Medicago truncatula under salt stress (23 ds/m NaCl) using qRT-PCR. MtPLD4 gene expression compared to that in control plants was increased 48 hr post-treatment. MtPLD13 gene expression decreased 48 hr post-treatment. Expression of the MtPLD9 and MtPLD15 genes increased in the early hours and then decreased compared to control plants. The results showed that the  α subgroup MtPLD genes in particular are valuable candidates for further functional genomics analysis.   اسید فسفاتیک, شوری, فسفولیپاز, PLD, Medicago truncatula phosphatidic acid , Salt stress, Phospholipase D (PLD), Medicago Truncatula 143 156 http://gebsj.ir/browse.php?a_code=A-10-223-1&slc_lang=fa&sid=1 Somayeh Allahi سمیه اللهی Allahi.somayeh@gmail.com 10031947532846001458 10031947532846001458 No Plant Biotechnology Department, Faculty of Agricultural Sciences. University of Guilan, Iran گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران Mohammad Mehdi Sohani محمد مهدی سوهانی msohani@guilan.ac.ir 10031947532846001459 10031947532846001459 Yes Plant Biotechnology Department, Faculty of Agricultural Sciences. University of Guilan, Iran گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران Hasan Hasani Kumleh حسن حسنی کومله kumleh@guilan.ac.ir 10031947532846001460 10031947532846001460 No Plant Biotechnology Department, Faculty of Agricultural Sciences. University of Guilan, Iran گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران