<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Genetic Engineering and Biosafety Journal</title>
<title_fa>مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی</title_fa>
<short_title>gebsj</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://gebsj.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2588-5073</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2588-5081</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>1</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61882/gebsj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>11</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>1111</journal_id_nlai>
<journal_id_science>11</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1397</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2018</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>7</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تنوع هاپلوتایپی QTL مرتبط با تحمل به خشکی روی کروموزوم شماره 2 برنج</title_fa>
	<title>Haplotype Diversity For QTL Associated with Drought tolerance on Chromosome 2 of Rice</title>
	<subject_fa>تخصصی متفرقه</subject_fa>
	<subject>Divers</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;به منظور بررسی تنوع هاپلوتایپی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;QTL&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;های کنترل&#8204;کننده تحمل به خشکی در گیاهچه&#8204;های 22 ژنوتیپ برنج، آزمایشی به صورت فاکتوریل در قالب طرح بلوک کامل تصادفی با سه تکرار و در محیط کنترل شده تحت شرایط نرمال&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; (بدون تنش)&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; و تنش خشکی انجام گرفت. 16 جفت نشانگر ریزماهواره مرتبط با تحمل به خشکی استفاده گردید. صفات مورد مطالعه شامل قطر ریشه، وزن &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;خشک &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;ریشه، تعداد ریشه، وزن خشک ساقه، طول ساقه، طول ریشه، کد ژنوتیپی و بیوماس کل بود&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; تجزیه واریانس صفات مورد بررسی نشان داد تفاوت بسیار معنی&#8204;داری&amp;nbsp; بین ژنوتیپ&#8204;ها از نظر صفات مورد مطالعه در دو شرایط نرمال رشد و تنش خشکی وجود داشت که بیانگر وجود تنوع ژنتیکی بین ژنوتیپ&#8204;های مورد مطالعه بود&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; 16 جفت نشانگر ریزماهواره در مجموع 49 آلل نشان دادند. تعداد آلل تولید شده به وسیله هر جفت آغازگر&amp;nbsp; از 2 تا 6 آلل متغیر بود که میانگین آن 3 آلل در هر لوکوس بود. محتوای اطلاعات چندشکلی (&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;PIC&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;)&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;دارای دامنه&#8204;ای&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; از 207/0 تا 678/0 با میانگین 462/0 بود. آغازگرهای &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;RM8030&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; و&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;RM3302 &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&amp;nbsp;مناسب&#8204;ترین آغازگرها برای تشخیص ژنوتیپ&#8204;های متحمل و حساس به تنش خشکی بودند و ممکن است در انتخاب به کمک نشانگر مفید باشند. ژنوتیپ&#8204;ها در 15 گروه هاپلوتایپی جای گرفتند و از رقم &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;Bala&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; به عنوان مرجع جهت بررسی تنوع هاپلوتایپی استفاده شد. گروه هاپلوتایپی شماره 1 شامل 4 ژنوتیپ سالاری، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;CT6516-24-3-2&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;IR77298-14-1-2&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;IR50&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; می&#8204;تواند جهت برنامه&#8204;های اصلاحی تحمل به تنش خشکی مفید باشد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:red;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br&gt;
&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;/span&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&amp;nbsp;In order to investigate the haplotype and allelic diversity of 22 rice (&lt;em&gt;Oryza sativa &lt;/em&gt;L.) genotypes, a factorial experiment was conducted based on RCBD with three replications under normal (no stress) and drought stress (-5 bar) conditions at seedling stage. The 16 primer pairs of SSR markers related to drought tolerance were used for genotyping. The studied traits were included root diameter, root dry weight, root number, root length, stem dry weight, stem length, genotypic score and total biomass. Analysis of variance for studied traits showed that there was a significant genetic variation among genotypes. 16 used SSR loci produced 49 alleles. The number of alleles per locus generated by each primer pair varied from 2 to 6 alleles with an average of 3. The polymorphic information content (PIC) values ranged from 0.207 to 0.678 with an average of 0.462. RM8030 and RM3302 microsatellite markers were useful for discriminating between tolerant and susceptible genotypes and therefore may be useful for marker-assisted selection. 15 haplotypes were identified among these genotypes using Bala haplotype as reference for haplotype diversity. Genotypes of haplotype group 1 including Salari, CT6516-24-3-2, IR77298-14-1-2 and IR50 genotypes can be useful for breeding programs to drought tolerance.</abstract>
	<keyword_fa> برنج, تنوع هاپلوتایپی, محتوای اطلاعات چندشکل, نشانگر SSR.</keyword_fa>
	<keyword>Haplotype diversity, PIC, Rice, SSR marker.</keyword>
	<start_page>217</start_page>
	<end_page>230</end_page>
	<web_url>http://gebsj.ir/browse.php?a_code=A-10-316-1&amp;slc_lang=en&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Parham</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Niksiar</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>پرهام</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نیک سیر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Parham.niksiar@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846002619</code>
	<orcid>10031947532846002619</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Plant Breeding, Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>اصلاح نباتات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Saeid</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Navvabpour</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سعید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نواب پور</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>s.navabpour@gau.ac.ir</email>
	<code>10031947532846002620</code>
	<orcid>10031947532846002620</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources. Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده تولید گیاهی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>hosein</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>sabouri</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حسین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>صبوری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>saboriho@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846002621</code>
	<orcid>10031947532846002621</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه کشاورزی گنبد کاووس</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>hasan</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>soltanlu</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حسن</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سلطانلو</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>soltanlooh@gau.ac.ir</email>
	<code>10031947532846002622</code>
	<orcid>10031947532846002622</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم کشاورزی گرگان</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>masoud</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>rahimi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مسعود</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رحیمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mahrahimi@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846002623</code>
	<orcid>10031947532846002623</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>M.Sc. of Plant Breeding</affiliation>
	<affiliation_fa>پژوهشگاه هسته ای کرج</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
