گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل ، Leila.fahmideh@yahoo.com
چکیده: (7111 مشاهده)
یکی از راهکارهای گیاهان برای کاهش مقدار سدیم سیتوزولی، دفع سدیم به خارج سلول است. این دفع خارج سلولی، مانع از اثرهای سمی سدیم در فرآیندهای سلولی سیتوزول میشود. ناقلهای سدیم/هیدروژن غشای پلاسمایی (SOS1) یکی از بهترین پروتئینهای درگیر در این فرآیند هستند. در این پژوهش از گیاه دولپه و شورزی Kochia scoparia به عنوان منبع برای جداسازی ژن استفاده شد. بر همین اساس با استفاده از آغازگرهای طراحی شده در مناطق حفاظت شده در گیاهان دیگر، طول تقریبی 3600 نوکلئوتیدی و به تبعیت از آن توالی 1200 اسیدآمینهای از توالی کدکنندۀ این ژن شناسایی و تعیین توالی شد. میزان شباهت این توالی در سطح نوکلئوتیدی با حداکثر 84 درصد همولوژی و در سطح اسیدآمینهای 92 درصد با استفاده از بررسی BLAST تأیید شد. تجزیه و تحلیلهای بعدی برای تعیین خصوصیات پروتئینی و ارتباطآن با پروتئینهای دیگر با استفاده از مطالعات بیوانفورماتیک انجام شد و نتایج نشان داد که منطقه حاوی مارپیچهای آلفای آبگریز به عنوان قطعۀ گذرنده از غشای پلاسمایی است و در مقابل آن دنبالۀ با تعداد کمتر مارپیچهای آلفای و خاصیت آبدوستی به عنوان قطعۀ داخل سلولی پروتئین میباشد. این نتایج نقش دفع سدیم توسط ناقلهای غشای پلاسمایی را برای وجود واکنش مقاومت به شوری در گیاه کوشیا تأیید نمود.
Nikkhah N, Fahmideh L, Fooladvand Z. Characterization and sequence of a hydrogen/sodium anti-porter gene in the plasma membrane of the plant Kochia scoparia. gebsj 2017; 5 (2) :113-122 URL: http://gebsj.ir/article-1-107-fa.html
نیکخواه ناهید، فهمیده لیلا، فولادوند زیبا. شناسایی و تعیین توالی ژن مربوط به آنتی پورتر هیدروژن/ سدیم از غشای پلاسمایی گیاه Kochia scoparia. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1395; 5 (2) :113-122