[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 5، شماره 1 - ( 1-1395 ) ::
جلد 5 شماره 1 صفحات 39-31 برگشت به فهرست نسخه ها
توصیف پروتئین های محافظت شده فرضی ازXanthomonas citri subsp. citri ، با فعالیت محرک تولید اتیلن درگیاه آرابیدوپسیس
وحید فلاح زاده ممقانی*
گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید مدنی آذربایجان ، fallahzadeh@azaruniv.edu
چکیده:   (5773 مشاهده)

در پژوهش­های پیشین از بخش خالص شده پروتئوم باکتری Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) که قابلیت محرک تولید اتیلن در گیاه آرابیدوپسیس را داشت، حدود 60 پروتئین مختلف شناسایی شدند که از بین آنها هشت پروتئین به عنوان پروتئین فرضی محافظت شده بودند. هدف از انجام این پژوهش توصیف این پروتئین­ها توسط ابزارهای بیوانفورماتیک مختلف می­باشد. همه پروتئین­های مورد بررسی دارای جرم مولکولی متوسطی بودند. پروتئین  NP_640497.1 با 84/43 کیلودالتون دارای بیشترین جرم مولکولی بود. نقطه ایزوالکتریک (pI) محاسبه شده برای پروتئین­ها بین 34/5 تا 5/9 متغییر بود. نوع خانواده­های پروتئینی و دمین­های پروتئین­ها توسط ابزار پایگاه اطلاعاتی دمین­های محافظت شده CDD-Blast و Interpro تعیین شد. از بین موارد مورد بررسی در پروتئین NP_640912.1 دمین HTH (Helix-turn-Helix)، از بخش مرکزی پروتئین NP_640497.1، دمین Enoyl_reductase، از پروتئین NP_641576.1 دو موتیف متصل شونده به یون کلسیم (EF-hand, calcium binding motif) و در پروتئین NP_643454.1 دمین 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase از بالاخانواده Hot_dog شناسایی شد. سرور COACH برای پیش­بینی جایگاه اتصال لیگاند در پروتئین­ها مورد استفاده قرار گرفت و ساختار سه بعدی آنها توسط سرور Phyre 2 مدل سازی شد. نتایج حاصل از این پژوهش می­تواند در شناخت بهتر باکتری Xcc و همچنین شناسایی پروتئین­هایی با خاصیت الیسیتوری از این باکتری به کار گرفته شوند.

واژه‌های کلیدی: زانتوموناس، بیوانفورماتیک، شانکر مرکبات، محرک، پروتئین
متن کامل [PDF 313 kb]   (3160 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: مهندسی ژنتیک میکروارگانیسم ها و ویروسها
دریافت: 1395/5/4 | پذیرش: 1395/8/21 | انتشار: 1395/9/17
ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Fallahzadeh Mamaghani V. Characterization of Conserved Hypothetical Proteins from Proteome of Xanthomonas citri subsp. citri, with Ethylene Induction Activity on Arabidopsis thaliana. Genetic Engineering and Biosafety Journal. 2016; 5 (1) :31-39
URL: http://gebsj.ir/article-1-130-fa.html

فلاح زاده ممقانی وحید. توصیف پروتئین های محافظت شده فرضی ازXanthomonas citri subsp. citri ، با فعالیت محرک تولید اتیلن درگیاه آرابیدوپسیس . مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1395; 5 (1) :39-31

URL: http://gebsj.ir/article-1-130-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 5، شماره 1 - ( 1-1395 ) برگشت به فهرست نسخه ها
دوفصل نامه علمی-پژوهشی مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی Genetic Engineering and Biosafety Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 30 queries by YEKTAWEB 4410