گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، تبریز، ایران ، eivazian@azaruniv.ac.ir
چکیده: (4 مشاهده)
پژوهش حاضر برای نواحی ژنتیکی حامل اطلاعات تبارزایی در گونههای جنس Heterorhabditis، مشتمل بر نواحی رونویسی شونده داخلی (Internal Transcribed Spacer)، ITS2، ITS1 ، سیتوکروم اکسیداز I (COX1) و زیرواحد بزرگ ریبوزومی DNA (28S-rDNA) مجموعهای از آغازگرهای نوین را معرفی میکند. همچنین این پژوهش کارایی نواحیمذکور در نشان دادن روابط نسب شناختی این گروه را بررسی میکند. نتایج این مطالعه نشان داد که دو ناحیه، یعنی ITS و 28S rDNA، در دستیابی به درختهایی با تفکیکپذیری بالا (highly resolved trees) همراه با پشتیبانی قوی از گرهها نقشی اساسی ایفا می کنند. درخت تبارزایی ساختهشده بر اساس ITS1، در گرههای عمیقتر، با داشتن مقادیر پایین بوتاسترپ از اطمینان کمتری برخوردار بود. در مقابل، درخت مبتنی بر ITS2 امتیازات بوتاسترپ بالاتری را برای گرههای داخلی ثبت کرد. چندریختی گره ریشه مشخصه درختهای حاصل از تجزیه و تحلیل ITS1 و ITS2 بود. با این حال، درخت ترکیبی ITS1 و ITS2 نتوانستند هماهنگی منطقی با درختهای مبتنی بر ITS1 یا ITS2 داشته باشد. ناهمخوانی عمدتاً حول جایگاه خوشه تک نیایی حاوی H. bacteriophora، H. beicherriana و H. georgiana بود. در تمام درختهای بازسازیشده حاصل از قطعات مختلف ITS، مقادیر بالایی از شاخصهای سازگاری (Consistency Index - CI) و ماندگاری (Retention Index - RI) مشاهده شد. با این وجود، درخت تبارزایی مبتنی بر COX1 مقادیر پایینتری از ارزش CI و RI را نشان داد که به ترتیب حاکی از برازش کمتر درخت با دادهها و درجه بالاتری از همسانی (homoplasy) میباشد. در نهایت، ناحیه ITS قدرت تمایز بینظیر و پشتیبانی شاخهای قابل اتکایی را ارائه داد و خود را به عنوان انتخاب بهینه برای مرزبندی قطعی گونههایHeterorhabditisتثبیت نمود. به کارگیری مجموعه آغازگرهای پیشنهادی، فرآیندهای تصمیمگیری آگاهانهای را که متکی بر چارچوبهای تبارزایی مستحکم هستند، تسهیل خواهد کرد.
Eivazian Kary N, Shirzad A. Exploring the Evolutionary Relationships within the Genus Heterorhabditis Using different Genomic Markers and Proposing Specific Primers for Each Region. gebsj 2026; 15 (1) : 3 URL: http://gebsj.ir/article-1-547-fa.html
عیوضیان کاری ناصر، شیرزاد اکبر. مطالعه روابط نسب شناختی جنس Heterorhabditis با استفاده از نشانگرهای ژنومی مختلف و پیشنهاد آغازگرهای اختصاصی برای هر ناحیه. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1405; 15 (1)
