[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
برای داوران::
ثبت نام و اشتراک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
بایگانی مقالات زیر چاپ::
::
::
راهنمای نگارش
..
شماره‌های چاپ شده

فایل لیست داوران مقالات 

دوره پانزدهم سال 1405
شماره اول
شماره دوم

دوره چهاردهم سال 1404
شماره اول
شماره دوم

دوره سیزدهم سال 1403
شماره اول
شماره دوم

دوره دوازدهم سال 1402
شماره اول
شماره دوم

دوره یازدهم سال 1401
شماره اول
شماره دوم
دوره دهم سال 1400
شماره اول
شماره دوم
دوره نهم سال 1399
شماره اول
شماره دوم
دوره هشتم سال 1398
شماره اول
شماره دوم

دوره هفتم سال 1397
دوره ششم سال 1396
دوره پنجم سال 1395
دوره چهارم سال 1394
دوره سوم سال 1393
دوره دوم سال 1392
دوره اول سال 1391
..
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
:: دوره 14، شماره 2 - ( 10-1404 ) ::
جلد 14 شماره 2 صفحات 281-269 برگشت به فهرست نسخه ها
طراحی و ساخت ناقل نوترکیب pTargetF حمل کننده gRNA ژن entB برای CRISPR/Cas9 در ایکلای سروگروه O2
محدثه امیری ، مهدی گلچین* ، عباس حاجی زاده ، حمیدرضا فرزین ، مجید جمشیدیان مجاور
گروه پاتوبیولوژی دانشکده دامپزشکی دانشگاه شهید باهنر کرمان، ایران. ، golchin@uk.ac.ir
چکیده:   (303 مشاهده)
کلی‌باسیلوز ناشی از Escherichia coli سروگروه O2 یکی از بیماری‌های مهم باکتریایی در صنعت طیور است که می‌تواند خسارات اقتصادی قابل توجهی ایجاد کند. افزایش مقاومت آنتی‌بیوتیکی در سویه‌های بیماری‌زا، ضرورت استفاده از راهکارهای جایگزین از جمله طراحی واکسن‌ها و سویه‌های تخفیف حدت‌یافته را برجسته کرده است. هدف از این مطالعه، طراحی و ساخت ناقل نوترکیب CRISPR/Cas9 حامل gRNA اختصاصی ژن entB در E. coli سروگروه O2 به‌عنوان گامی اولیه در مسیر طراحی سویه تخفیف حدت‌یافته بود. در این مطالعه، gRNA اختصاصی علیه ژن entB با استفاده از پایگاه CHOPCHOP طراحی شد. الیگونوکلئوتیدهای رفت و برگشت مربوط به gRNA سنتز شده و پس از آنیلینگ (annealing)، درون پلاسمید pTargetF خطی‌شده با آنزیم BbsI، با استفاده از T4 DNA Ligase جایگذاری شدند. ناقل نوترکیب حاصل به سلول‌های مستعد DH5α منتقل شد و ورود قطعه gRNA به داخل وکتور با استفاده از واکنش زنجیره‌ای پلیمراز و همچنین تعیین توالی تأیید گردید. نتایج نشان داد که توالی راهنمای طراحی‌شده با موفقیت در وکتور pTargetF کلون شده است. مشاهده باندهای مورد انتظار در آزمون PCR، صحت ساخت سازه نوترکیب را تأیید کرد. بر اساس یافته‌های این پژوهش، ناقل نوترکیب طراحی‌شده می‌تواند به‌عنوان ابزاری مقدماتی برای هدف‌گیری ژن entB و مطالعات بعدی در زمینه تخفیف حدت سویه‌های بیماری‌زای E. coli طیور مورد استفاده قرار گیرد.

 
واژه‌های کلیدی: اشریشیا کلی، سروگروه O2، CRISPR/Cas9، entB، gRNA، ناقل نوترکیب، کلی‌باسیلوز
متن کامل [PDF 1112 kb]   (37 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: مهندسی ژنتیک میکروارگانیسم ها و ویروسها
دریافت: 1404/12/1 | پذیرش: 1404/12/28 | انتشار: 1404/12/28
فهرست منابع
1. Ashaar-Ghadim, E., Pazhouhandeh, M., Ahmadabadi, M. (2022). Potato Genome Editing Using CRISPR Technologies. gebsj , 11 (2) : 11. DOR:20.1001.1.25885073.1401.11.2.13.2.
2. Barrangou, R., Fremaux, C., Deveau, H., Richards, M., Boyaval, P., Moineau, S., & Horvath, P. (2007). CRISPR provides acquired resistance against viruses in prokaryotes. Science, 315(5819), 1709-1712. doi:10.1126/science.1138140. [DOI:10.1126/science.1138140] [PMID]
3. Chandrasegaran, S., & Carroll, D. (2016). Origins of Programmable Nucleases for Genome Engineering. Journal of Molecular Biology, 428(5 Pt B), 963-989. doi:10.1016/j.jmb.2015.10.014. [DOI:10.1016/j.jmb.2015.10.014] [PMID] [PMCID]
4. Dziva, F., & Stevens, M. P. (2008). Colibacillosis in poultry: unravelling the molecular basis of virulence of avian pathogenic Escherichia coli in their natural hosts. Avian Pathology, 37(4), 355-366. doi: 10.1080/03079450802216652. [DOI:10.1080/03079450802216652] [PMID]
5. Gehring, A. M., Mori, I., & Walsh, C. T. (1998). Reconstitution and characterization of the Escherichia coli enterobactin synthetase from EntB, EntE, and EntF. Biochemistry, 37(8), 2648-2659. doi: 10.1021/bi9726584. [DOI:10.1021/bi9726584] [PMID]
6. Hille, F., Richter, H., Wong, S. P., Bratovič, M., Ressel, S., & Charpentier, E. (2018). The Biology of CRISPR-Cas: Backward and Forward. Cell, 172(6), 1239-1259. doi: 10.1016/j.cell.2017.11.032. [DOI:10.1016/j.cell.2017.11.032] [PMID]
7. Hryhorowicz, M., Lipiński, D., Zeyland, J., & Słomski, R. (2017). CRISPR/Cas9 Immune System as a Tool for Genome Engineering. Archivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis, 65(3), 233-240. doi:10.1007/s00005-016-0427-5. [DOI:10.1007/s00005-016-0427-5] [PMID] [PMCID]
8. Kordzadeh-Kermani, Z., Kheirandish, R., Sasan, H. ( 2023). Delivery methods of CRISPR/Cas-mediated genome editing system. Gebsj,12 (1) ,145-156. DOR:20.1001.1.25885073.1402.12.1.8.2
9. Johnson, J. R., & Russo, T. A. (2002). Extraintestinal pathogenic Escherichia coli: "the other bad E coli". Journal of Laboratory and Clinical Medicine, 139(3), 155-162. doi: 10.1067/mlc.2002.121550. [DOI:10.1067/mlc.2002.121550] [PMID]
10. Loureiro, A., & da Silva, G. J. (2019). CRISPR-Cas: Converting A Bacterial Defence Mechanism into A State-of-the-Art Genetic Manipulation Tool. Antibiotics, 8(1), 18. doi:10.3390/antibiotics8010018. [DOI:10.3390/antibiotics8010018] [PMID] [PMCID]
11. Mojica, F. J. M., & Montoliu, L. (2016). On the Origin of CRISPR-Cas Technology: From Prokaryotes to Mammals. Trends in Microbiology, 24(10), 811-820. doi: 10.1016/j.tim.2016.06.005. [DOI:10.1016/j.tim.2016.06.005] [PMID]
12. Mojica, F. J., & Rodriguez-Valera, F. (2016). The discovery of CRISPR in archaea and bacteria. The FEBS Journal, 283(17), 3162-3169. doi:10.1111/febs.13766. [DOI:10.1111/febs.13766] [PMID]
13. Pakarian, P., & Pawelek, P. D. (2016). Intracellular co-localization of the Escherichia coli enterobactin biosynthetic enzymes EntA, EntB, and EntE. Biochemical and Biophysical Research Communications, 478(1), 25-32. doi:1016/j.bbrc.2016.07.105. [DOI:10.1016/j.bbrc.2016.07.105] [PMID]
14. Poole, K., Young, L., & Neshat, S. (1990). Enterobactin-mediated iron transport in Pseudomonas aeruginosa. Journal of Bacteriology, 172(12), 6991-6996. doi:10.1128/jb.172.12.6991-6996.1990. [DOI:10.1128/jb.172.12.6991-6996.1990] [PMID] [PMCID]
15. Samare Gholami, A., Sasan, H. A., Hashemabadi, M., & Ravan, H. (2019). Design and Construction of Recombinant CRISPR Vector Harboring LRRK2 Gene for Parkinson's Disease. Cell and Tissue Journal, 10(4), 214-225. doi :10.52547/JCT.10.4.214
16. Shmakov, S., Smargon, A., Scott, D., Cox, D., Pyzocha, N., Yan, W., Abudayyeh, O. O., Gootenberg, J. S., Makarova, K. S., Wolf, Y. I., Severinov, K., Zhang, F., & Koonin, E. V. (2017). .Diversity and evolution of class 2 CRISPR-Cas systems. Nature Reviews Microbiology, 15(3), 169-182. doi: 10.1038/nrmicro.2016.184. [DOI:10.1038/nrmicro.2016.184] [PMID] [PMCID]
17. Wang, H., Cao, L., Logue, C. M., Barbieri, N. L., Nolan, L. K., & Lin, J. (2023). Evaluation of immunogenicity and efficacy of the enterobactin conjugate vaccine in protecting chickens from colibacillosis. Vaccine, 41(4), 930-937. doi:10.1016/j.vaccine.2022.12.057. [DOI:10.1016/j.vaccine.2022.12.057] [PMID]
18. Yogaratnam, V. (1995). Analysis of the causes of high rates of carcase rejection at a poultry processing plant. The Veterinary Record, 137(9), 215-217. doi:10.1136/vr.137.9.215. [DOI:10.1136/vr.137.9.215] [PMID]
ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Amiri M, Golchin M, Hajizade A, Farzin H, Jamshidian-Mojaver M. Design and Construction of a Recombinant pTargetF Vector Carrying an entB gRNA for the CRISPR/Cas9 in E. coli Serogroup O2. gebsj 2026; 14 (2) :269-281
URL: http://gebsj.ir/article-1-554-fa.html

امیری محدثه، گلچین مهدی، حاجی زاده عباس، فرزین حمیدرضا، جمشیدیان مجاور مجید. طراحی و ساخت ناقل نوترکیب pTargetF حمل کننده gRNA ژن entB برای CRISPR/Cas9 در ایکلای سروگروه O2. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1404; 14 (2) :269-281

URL: http://gebsj.ir/article-1-554-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 14، شماره 2 - ( 10-1404 ) برگشت به فهرست نسخه ها
دوفصل نامه علمی-پژوهشی مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی Genetic Engineering and Biosafety Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.23 seconds with 39 queries by YEKTAWEB 4772