[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 4، شماره 1 - ( 1-1394 ) ::
جلد 4 شماره 1 صفحات 54-41 برگشت به فهرست نسخه ها
شناسایی و گروه بندی خانواده عوامل رونویسی WRKY در جو
بنیامین یزدانی، رسول اصغری زکریا، زهرا سادات شبر*
پژ.هشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ، shobbar@abrii.ac.ir
چکیده:   (4494 مشاهده)

تنش‌‌‌‌‌های زیستی و غیر­زیستی از مهمترین عوامل محدود­کننده عملکرد گیاهان زراعی مانند جو هستند. عوامل رونویسی در تنظیم ژن‌های پاسخ ­دهنده به این تنش‌ها دخالت دارند که خانواده ژنی WRKY رمز کننده گروه بزرگی از آنهاست. بنابراین شناسایی و مطالعه این خانواده ژنی می‌تواند گامی موثر برای ایجاد تحمل به تنش‌ها در گیاهان باشد. در پژوهش حاضر، دانستنی‌های مربوط به اعضای خانواده WRKY جو از پایگاه‌های داده جمع آوری شدند. با انتخاب یک عضو از هر زیر گروه ژن‌های WRKY در برنج، tBLASTN در پایگاه داده‌های IBSC و NCBI انجام شد تا اعضای احتمالی دیگر این خانواده نیز اضافه شدند. بر اساس مدل مخفی مارکوف، جستجو برای توالی‌های دارای منطقه حفاظت شده WRKY علیه همه پروتئین‌های این خانواده و هر زیر گروه آنها انجام شد. اعضای پیدا شده که شامل 96 عضو و یک توالی از هر زیرگروه عوامل رونویسی WRKY از گیاهان آرابیدوپسیس، برنج و گندم بودند، به صورت چندگانه هم ردیف شده و درخت فیلوژنتیک آنها رسم شد. توالی‌های موجود بر مبنای تعداد پهنه‌های WRKY و ساختار انگشت روی موجود در سه ‌گروه دسته‌بندی شدند. بر این اساس ۱۳پروتئین در گروه I،3۰ پروتئین‌ با ساختار انگشت روی Cx7Cx23HxC در گروه III و بقیه پروتئین‌ها با ساختار انگشت روی Cx4-5Cx22-23HxH در گروه II قرار گرفتند. با توجه به نقش گروه III در تحمل گیاه به تنش­های زیستی و غیر زیستی، فزونی درصد حضور اعضای این گروه در جو همانند گندم نسبت به میانگین گیاهان عالی را می­توان با مضاعف شدگی در اجداد وحشی تک لپه ­ای­ ها و انتخاب طبیعی برای ارقام مقاوم‌تر در شرایط نامساعد محیطی در ارتباط دانست.

واژه‌های کلیدی: جو خانواده ژنی WRKY درخت فیلوژنتیک عوامل رونویسی مدل مخفی مارکوف
متن کامل [PDF 577 kb]   (2979 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: مهندسی ژنتیک جانوری
دریافت: 1393/4/18 | پذیرش: 1394/4/10 | انتشار: 1395/11/27
ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Yazdani B, Asghari-Zakaria R, Shobbar Z. Identification and classification of the WRKY transcription factors family in barley. Genetic Engineering and Biosafety Journal. 2015; 4 (1) :41-54
URL: http://gebsj.ir/article-1-81-fa.html

یزدانی بنیامین، اصغری زکریا رسول، شبر زهرا سادات. شناسایی و گروه بندی خانواده عوامل رونویسی WRKY در جو. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1394; 4 (1) :54-41

URL: http://gebsj.ir/article-1-81-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 4، شماره 1 - ( 1-1394 ) برگشت به فهرست نسخه ها
دوفصل نامه علمی-پژوهشی مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی Genetic Engineering and Biosafety Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 30 queries by YEKTAWEB 4410