گروه زیستشناسی گیاهی و سلولی و مولکولی، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران ، sz.bakhti@tabrizu.ac.ir
چکیده: (6 مشاهده)
چکیده زمینه:سرطان معده (GC) همچنان یکی از مهمترین علل مرگومیر ناشی از سرطان در سراسر جهان محسوب میشود. ایمنیدرمانی، بهویژه در قالب واکسنهای مبتنی بر لنفوسیتهای T سیتوتوکسیک (CTL) که آنتیژنهای اختصاصی تومور را هدف قرار میدهند، بهعنوان یک رویکرد درمانی امیدبخش مطرح شده است. با این حال، طراحی مؤثر واکسنهای چنداپیتوپی با ایمنیزایی بالا، اختصاصیت توموری مناسب و پایداری ساختاری مطلوب، فرایندی پیچیده و چالشبرانگیز است.اهداف:هدف از انجام این مطالعه، طراحی یک واکسن چنداپیتوپی مبتنی بر لنفوسیتهای T سیتوتوکسیک و ارزیابی ساختار آن بود که با بهرهگیری از روشهای تلفیقی ایمونوانفورماتیک و واکسنشناسی ساختاری، پروتئینهای غشایی با بیان بالا در سرطان معده را مورد هدف قرار میدهد.مواد و روشها:اپیتوپهای CTL نهاسیدآمینهای که بهصورت تجربی تأیید شده بودند، از پنج پروتئین غشایی مرتبط با سرطان معده انتخاب شدند. بهمنظور افزایش ایمنیزایی و تسهیل پردازش آنتیژن، ادجوانت β-دفنسین ۳ به همراه لینکرهای مناسب به سازه واکسنی افزوده شد. سپس ویژگیهای فیزیکوشیمیایی واکسن، آلرژنبودن و سمیت، مدلسازی ساختار سهبعدی، اعتبارسنجی با نمودار راماچاندران و داکینگ مولکولی با مولکول HLA-A*0201 مورد بررسی قرار گرفت.یافتهها: واکسن طراحیشده دارای ویژگیهای فیزیکوشیمیایی مطلوب، پایداری بالا و فاقد خاصیت آلرژنی و سمیت بود. تحلیل ساختاری نشان داد که 8/87 درصد از باقیماندههای اسیدآمینهای در نواحی مطلوب قرار دارند که بیانگر تاخوردگی صحیح و یکپارچگی ساختاری مناسب است. نتایج داکینگ مولکولی نیز اتصال قوی واکسن به HLA-A*0201 (با انرژی اتصال 2/874- کیلوکالری بر مول) را نشان داد که حاکی از ارائه مؤثر توسط MHC-I و توانایی القای پاسخ مناسب CTL است.نتیجهگیری:واکسن CTL چنداپیتوپی طراحیشده بهصورت in silico ، از نظر ایمنیزایی و ساختاری ویژگیهای امیدوارکنندهای داشته و میتواند بهعنوان یک گزینه بالقوه برای ایمنیدرمانی شخصیسازیشده در سرطان معده مطرح شود. انجام مطالعات تکمیلی از جمله شبیهسازی دینامیک مولکولی، بررسی پوشش طیف گستردهتری از آللهای HLA و ارزیابیهای آزمایشگاهی، برای تأیید کارایی، ایمنی و امکان انتقال به کاربردهای بالینی ضروری است.
Mohammadi K, Bakhti S Z. In Silico Design and Structural Validation of a Multi-Epitope Cytotoxic T Lymphocyte Vaccine Targeting Membrane-Associated Proteins in Gastric Cancer. gebsj 2025; 14 (2) : 2 URL: http://gebsj.ir/article-1-536-fa.html
محمدی کیانوش، بختی سیده زهرا. طراحی in silico و اعتبارسنجی ساختاری یک واکسن چنداپیتوپیِ لنفوسیت T سیتوتوکسیک با هدفگیری پروتئینهای غشایی در سرطان معده. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1404; 14 (2)
