[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 6، شماره 1 - ( 4-1396 ) ::
جلد 6 شماره 1 صفحات 49-63 برگشت به فهرست نسخه ها
مطالعه in silico خانواده ژنی پلی‌آمین اکسیداز (PAO) در انگور
امین عابدی، محمد مهدی سوهانی ، رضا شیرزادیان خرم آباد
گروه بیوتکنولوژی کشاورزی دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران
چکیده:   (421 مشاهده)
پلی­ آمین اکسیدازها (PAO) آنزیم­های وابسته به فلاوین آدنین دی­نوکلئوتید هستند که در کاتابولیسم پلی­آمین­ها در پراکسی­ زوم، آپوپلاست و سیتوپلاسم نقش دارند. گزارش­های زیادی در زمینه اهمیت ژن­های PAO گیاهان در پاسخ به تنش­ها ارائه شده است با این حال مطالعه جامعی در مورد تعداد، روابط تکاملی، ساختار ژنی و الگوی بیانی ژن­های PAO در انگور موجود نیست. در مطالعه حاضر با استفاده از روش­های بیوانفورماتیکی، هشت ژن محتمل PAO (VvPAO1-VvPAO8) در ژنوم انگور 12X شناسایی شد. بر اساس مطالعه فیلوژنتیکی ژن­های VvPAO به سه گروه تقسیم می­شوند که هر گروه از نظر جایگاه سلولی و کارکرد اختصاصی است. ژن­های VvPAO دارای صفر تا 9 اینترون می‌باشند و بر روی 6 کروموزوم از 19 کروموزوم انگور قرار گرفته ­اند. وجود چندین عنصر تنظیمی cis پاسخ به تنش­ها و هورمون­ها در پیشبر این ژن­ها دلالت بر نقش احتمالی آن­ها در پاسخ به تنش­ها دارد. بررسی داده­ های ریزآرایه ژن­های اورتولوگ PAO انگور در آرابیدوپسیس در شرایط تنش­های غیر زیستی نشان داد که سطح رونویسی این ژن­ها در پاسخ به تنش­های غیر زیستی افزایش می­یابد که نشان دهنده نقش این ژن­ها در پاسخ انگور به تنش­ها است. نتایج این مطالعه داد­های پایه برای پژوهش­های بیشتر در مورد نقش ژن­های PAO در انگور را فراهم می­سازد.
 
واژه‌های کلیدی: بررسی فیلوژنتیکی، بیان ژن، بیوانفورماتیک، پلی آمین، تنش غیر زیستی
متن کامل [PDF 423 kb]   (50 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: تخصصی متفرقه
دریافت: ۱۳۹۵/۱۰/۲۴ | پذیرش: ۱۳۹۶/۴/۱۹ | انتشار: ۱۳۹۶/۵/۱۹
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

کد امنیتی را در کادر بنویسید >



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Abedi A, Sohani M M, Shirzadian-Khoramabad R. In silico study of polyamine oxidase (PAO) gene family in grape . Genetic Engineering and Biosafety Journal. 2017; 6 (1) :49-63
URL: http://gebsj.ir/article-1-161-fa.html
عابدی امین، سوهانی محمد مهدی، شیرزادیان خرم آباد رضا. مطالعه in silico خانواده ژنی پلی‌آمین اکسیداز (PAO) در انگور . مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1396; 6 (1) :49-63

URL: http://gebsj.ir/article-1-161-fa.html

دوره 6، شماره 1 - ( 4-1396 ) برگشت به فهرست نسخه ها
دوفصل نامه علمی-پژوهشی مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی Genetic Engineering and Biosafety Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.053 seconds with 796 queries by yektaweb 3531