[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 6، شماره 2 - ( 12-1396 ) ::
جلد 6 شماره 2 صفحات 189-203 برگشت به فهرست نسخه ها
مطالعه شبکه ژنی موثر بر رشد ماهیچه سینه جوجه راس تحت داده‌های RNA-Seq
سید نادر آلبوشوکه، مجتبی طهمورث پور ، محمدرضا بختیاری زاده، محمدرضا نصیری، سعید اسماعیل خانیان
گروه علوم دامی ، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران
چکیده:   (566 مشاهده)
جوجه های بومی جز مهم‌ترین ذخایر ژنتیکی هستند که به شرایط محیطی بخوبی سازگاری یافته‌اند. اما بطور معمول سرعت رشد و راندمان غذایی آنها در مقایسه با جوجه‌های امروزی مناسب است. مطالعات مقایسه‌ای بین جوجه‌های امروزی و مرغان بومی امکان درک علل این تفاوت‌های ژنتیکی را مهیا می‌سازد. جهت بررسی تفاوت‌های ترانسکریپتومی ژن‌ها و مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با رشد ماهیچه سینه در دو گروه مرغ بومی و جوجه تجاری از مطالعات ژنومی تکنولوژی‌های توالی‌یابی نسل آینده استفاده شد. در این پژوهش تعداد 200 قطعه پرنده از سویه راس 708 و 200 قطعه جوجه بومی اصفهان در یک شرایط مشابه مدیریتی و تغذیه استاندارد پرورش داده شدند. در بررسی تجزیه و تحلیل داده‌هایRNA-Seq  بین دو گروه آزمایشی، پروفایل بیان ژن در 4 نمونه ماهیچه سینه 28 روزگی عمر جوجه‌ها مورد مقایسه قرار گرفت. مقایسه آماری بیان ژن‌های توالی‌یابی شده در این دو گروه، 606 ژن با تفاوت معنی‌دار را مشخص کرد. در جوجه تجاری از این تعداد 357 ژن افزایش بیان و 249 ژن کاهش بیان نشان دادند. شبکه برهم کنش پروتئین- پروتئین (Protein-protein interaction) با استفاده از 267 ژن تشکیل و از این تعداد 75 ژن در قالب سه ماژول با حداکثر سطح معنی‌داری شناسایی شد. بررسی‌های هستی شناسی ژنی نشان داد هر سه ماژول در رشد ونموی ماهیچه سینه نقش موثری را ایفا کرده و ژن‌های شاخص آن‌ها JUN، EGR1، THBS1، ITGA4 و ACTA2 بودند.
 
واژه‌های کلیدی: جوجه راس، شبکه ژنی، میوژن، هستی شناسی ژن، RNA-Seq
متن کامل [PDF 1010 kb]   (647 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: مهندسی ژنتیک جانوری
دریافت: ۱۳۹۶/۶/۱ | پذیرش: ۱۳۹۶/۶/۱۵ | انتشار: ۱۳۹۶/۱۲/۱۵
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA code


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Albooshoke S N, Tahmoorespur M, Bakhtiarizadeh M, Nassiri M, Esmaeikhanian S. Study of the genetic network that affecting the growth of breast muscle in Ross chickens under RNA-Seq data. Genetic Engineering and Biosafety Journal. 2018; 6 (2) :189-203
URL: http://gebsj.ir/article-1-211-fa.html

آلبوشوکه سید نادر، طهمورث پور مجتبی، بختیاری زاده محمدرضا، نصیری محمدرضا، اسماعیل خانیان سعید. مطالعه شبکه ژنی موثر بر رشد ماهیچه سینه جوجه راس تحت داده‌های RNA-Seq. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1396; 6 (2) :189-203

URL: http://gebsj.ir/article-1-211-fa.html



دوره 6، شماره 2 - ( 12-1396 ) برگشت به فهرست نسخه ها
دوفصل نامه علمی-پژوهشی مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی Genetic Engineering and Biosafety Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 31 queries by YEKTAWEB 3764