[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 7، شماره 1 - ( 5-1397 ) ::
جلد 7 شماره 1 صفحات 1-11 برگشت به فهرست نسخه ها
تجزیه و تحلیل تبارزائی و تنوع ژنتیکی ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجه فرنگی در عراق براساس ژن V1
مهند الوائلی، اکبر دیزجی* ، غلامحسین مصاحبی، اکبر آهنگران
گروه گیاهپزشکی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران
چکیده:   (235 مشاهده)

ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجه فرنگی (Tomato yellow leaf curl virus, TYLCV)  از مهمترین بیمارگرهای مناطق گرمسیری و نیمه گرمسیری است. طی سال های 1396- 1395، تعداد 393 نمونه گوجه فرنگی دارای علائم بیماری پیچیدگی برگ زرد گوجه فرنگی از شش استان مختلف عراق جمع آوری شد. در آزمون ساندویچ دوطرفه الایزا (DAS-ELSA)، 55 نمونه (14 درصد) با آنتی بادی های اختصاصی TYLCV واکنش مثبت نشان داد. پس از استخراج دی. ان. ا کل، آلودگی 21 (از 55) نمونه با واکنش مثبت در الایزا به TYLCV با واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR)  تایید و ژن پروتئین پوششی V1  16جدایه از ویروس با استفاده از جفت آغازگر اختصاصی تکثیر، همسانه سازی و تعیین ترادف شد. براساس همردیف سازی ترادف نوکلئوتیدی، بالاترین میزان یکسانی نوکلئوتیدی ژن پروتئین پوششی این جدایه ها (6/99- 1/94 درصد) با جدایه های این ویروس از کویت  (KJ830841) و عراق  (JQ354991) تعیین شد. در تحلیل تبارزایی براساس ترادف نوکلئوتیدی V1، جدایه های عراق، بدون ارتباط با منشا جغرافیایی، در دو گروه و چهار زیرگروه قرار گرفتند. شاخص های تنوع ژنتیکی براساس این ناحیه ژنومی ویروس حاکی از وجود تنوع ژنتیکی زیاد در زیرجمعیت های عراقی بود. نسبت  جانشینی های نامترادف به جانشینی های مترادف Pi(a)/Pi(s)   کمتر از یک (1>) این ژن، نشان دهنده تاثیر فشار انتخابی منفی روی آن می باشد. همچنین جریان ژنی کمی بین دو زیرجمعیت مرکزی و جنوبی عراق تعیین شد که نشان دهنده تمایز ژنتیکی جدایه ها در این نواحی از کشور می باشد. این مطالعه اولین پژوهش در خصوص بررسی پراکنش جغرافیایی و تنوع ژنتیکی TYLCV در عراق می باشد. تعیین ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل جدایه ها به منظور تعیین سویه ویروس ضروری می باشد.

واژه‌های کلیدی: بگوموویروس، تنوع ژنتیکی، عراق، گوجه فرنگی
متن کامل [PDF 895 kb]   (67 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: مهندسی ژنتیک میکروارگانیسم ها و ویروسها
دریافت: ۱۳۹۷/۲/۲۸ | پذیرش: ۱۳۹۷/۴/۲۶ | انتشار: ۱۳۹۷/۵/۱۲
ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA code


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Al-Waeli M, Dizadji A, Mossahebi G H, Ahangaran A. Phylogenetic analysis and genetic variation of Tomato yellow leaf curl virus based on the V1 gene in Iraq . Genetic Engineering and Biosafety Journal. 2018; 7 (1) :1-11
URL: http://gebsj.ir/article-1-250-fa.html

الوائلی مهند، دیزجی اکبر، مصاحبی غلامحسین، آهنگران اکبر. تجزیه و تحلیل تبارزائی و تنوع ژنتیکی ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجه فرنگی در عراق براساس ژن V1. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1397; 7 (1) :1-11

URL: http://gebsj.ir/article-1-250-fa.html



دوره 7، شماره 1 - ( 5-1397 ) برگشت به فهرست نسخه ها
دوفصل نامه علمی-پژوهشی مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی Genetic Engineering and Biosafety Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 31 queries by YEKTAWEB 3790