|
بررسی تنوع ژنتیکی و رابطه فیلوژنتیکی برخی ژنوتیپ های کدو با استفاده از مکان ژن ریبوزومی ITS و ژن کلروپلاستی rbcL
|
مرضیه شیخی   ، براتعلی فاخری* ، نفیسه مهدی‌نژاد |
| گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، ایران ، fakheri@uoz.ac.ir |
|
|
چکیده: (4791 مشاهده) |
| روش بارکدگذاری DNA پتانسیل زیادی برای احیاء علم آرایه‌شناسی و مطالعات تنوع زیستی سنتی دارد؛ لذا این روش تاکنون به‌طور گستردهای بر روی گیاهان و با اهداف رده‌بندی و آرایه‌شناسی استفاده شده است. در این پژوهش هشت ژنوتیپ مختلف کدو (Cucurbita pepo) در گلدان در قالب طرح کاملاً تصادفی در گلخانه کشت و در مرحله چهار برگی، برگهای جوان به‌عنوان نمونه برداشت گردید. در گام بعد استخراج DNA، ارزیابی کمی و کیفی آن، PCR و سپس توالییابی محصولات PCR انجام شد و تجزیه دادهها با استفاده از نرم‌افزار Clustalw2 و BioEdit صورت پذیرفت. نتایج نشان داد که در توالی نوکلئوتیدی ژن ITS در خانواده کدو، باز سیتوزین (5/29) بیشترین فراوانی و باز آدنین (3/20) کمترین فراوانی و در توالی نوکلئوتیدی ژن rbcL باز آدنین (4/27) بیشترین فراوانی و باز سیتوزین (1/20) کمترین فراوانی را داشت. برآورد جایگزینی نوکلئوتیدی ژنهای rbcL و ITS در خانواده کدو، مقادیر بالای جایگزینی پیریمیدینی را نشان داد. به‌طوری‌که درصد تبدیل تیمین به سیتوزین در توالیهای نوکلئوتیدهای ژن ITS و rbcL به ترتیب 69/31 و 43/20 درصد و درصد تبدیل سیتوزین به تیمین بهترتیب 05/47 و 04/16 درصد بهدست آمد، پرایمر ITS موفق به شناسایی و تفکیک تنها ۵ ژنوتیپ گردید در حالیکه rbcL هر ۸ ژنوتیپ را شناسایی کرد. بنابراین پرایمر rbcL جهت توالی یابی کدو مناسب‌تر است. |
|
| واژه‌های کلیدی: بارکد گذاری DNA، ITS، rbcl، کدو |
|
|
متن کامل [PDF 595 kb]
(1245 دریافت)
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
مهندسی ژنتیک گیاهی
دریافت: 1398/5/6 | پذیرش: 1398/9/15 | انتشار: 1398/11/14
|
|
|
|
|
|
|
| ارسال نظر درباره این مقاله |
|
|
|
