|
شناسایی رونوشت‌های حلقوی سویا در پاسخ به تنش کمبود نیتروژن و فسفر
|
| سعید بابائی، اسماعیل ابراهیمی*، علی نیازی، مهناز نظامیوند چگینی |
| پژوهشکده بیوتکنولوژی دانشگاه شیراز ، ebrahimie@shirazu.ac.ir |
|
|
چکیده: (242 مشاهده) |
| سویا که به عنوان یکی از مهمترین منابع روغن و پروتئین در جهان شناخته می‌شود، مانند دیگر گونه‌های گیاهی در معرض تنش‌های غیرزیستی متنوعی قرار دارد. از جمله تنش‌های محدود کننده رشد و میزان تولید محصول در سویا، تنش‌های کمبود فسفر و نیتروژن هستند. رونوشت‌های حلقوی که به عنوان رونوشت‌های جدید غیر رمزکننده شناخته می‌شوند، نقش مهمی در پاسخ گیاهان به تنش‌های زیستی و غیرزیستی بر عهده دارند. با این حال، چگونگی بیان رونوشت‌های حلقوی در سویا در پاسخ به تنش کمبود فسفر و نیتروژن هنوز به طور دقیق مشخص نشده است. در این مطالعه بذرهای سویا تحت تنش‌های مختلف کمبود فسفر و نیتروژن کشت شد و نمونه برداری از ریشه گیاهان جهت استخراج ترانسکریپتوم انجام شد. پس از استخراج ترانسکریپتوم و اطمینان از کمیت و کیفیت آن، نمونه‌ها جهت توالی‌یابی به شرکت ماکروژن کره جنوبی ارسال شدند. پس از دریافت نتایج حاصل از توالی‌یابی، کیفیت داده‌ها مورد ارزیابی قرار گرفت و رونوشت‌های حلقوی با استفاده از پنچ روش مختلف شناسایی شدند. در نهایت نحوه و الگوی بیان رونوشت‌های حلقوی و نیز عملکرد ژن‌های رمز کننده آن‌ها مورد بررسی قرار گرفت. نتایج حاصل از توالی‌یابی بیش از 360 میلیون خوانش تولید کرد و در مجموع 2033 رونوشت حلقوی در همه تیمارها شناسایی شد. با وجود اینکه برخی از رونوشت‌های حلقوی به طور همزمان در دو یا چند تیمار بیان شدند، اکثر آن‌ها الگوی بیان وابسته به نوع تیمار تنش داشتند. نتایج نشان داد که رونوشت‌های حلقوی احتمالا از طریق اتصال به مولکول‌های هدف، نقش خود را ایفا می‌کنند. نتایج به دست آمده در این مطالعه نقش احتمالی رونوشت‌های حلقوی در پاسخ به تنش کمبود نیتروژن و فسفر را پیشنهاد می‌کند. |
|
| واژه‌های کلیدی: سویا، تنش، فسفر، نیتروژن، رونوشت حلقوی |
|
|
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
مهندسی ژنتیک گیاهی
دریافت: 1399/6/2 | پذیرش: 1399/8/20 | انتشار: 1399/8/25
|
|
|
|
|
|
|
| ارسال نظر درباره این مقاله |
|
|
|
