|
طراحی پلی توپ واکسن علیه ویبریو کلرا: رویکردی وارونه برای طراحی واکسن
|
مینا عقبی طلب   ، محمدجواد دهقان عصمت ابادی* ، علیرضا سعیدی نیا ، محمدعلی یعقوبی مقدم |
| مجتمع دانشگاهی شیمی و مهندسی شیمی، دانشگاه صنعتی مالک اشتر، تهران، ایران ، mohammad_dehghan@mut.ac.ir |
|
|
چکیده: (3700 مشاهده) |
| طراحی واکسن درگذشته تا به امروز براساس روشهای کلاسیک صورت میگیرد که زمانبر، هزینهبر و دارای ملاحظاتی هستند، اما با کشف ژنوم و تعیین توالی ژن، روشهای مدرنی برای طراحی واکسن ابداع شده که از جمله آن میتوان به روش طراحی واکسن به روش معکوس اشاره کرد. در این پژوهش از سرور NCBI (ORF Finder) به منظور یافتن توالیهای Coding و برای مکانیابی پروتئین از سرور PSORTb استفاده شده و بررسی آلرژنیک بودن پروتئین از سرور Algpred و به منظور پیشبینی اپی توپ خطی و فضایی از سرورهای LBtope – ABCpred - IEDB CBTOPE - Disco Tope 2.0 – IEDB (Ellipro) اپی توپ نهایی انتخاب شده و سپس تجزیه و تحلیل سازه پلی توپی را توسط سرور ExPasy (ProtParam) بررسی کردیم و در نهایت با سرور JCat توالی نوکلئوتیدی بهینه شده را بدست آوردیم. با استفاده از این روش 6074 چارچوب خوانش و همچنین 43 پروتیین سطحی و ترشحی شناسایی گردیده که در نهایت، 10 اپی توپ مناسب به عنوان کاندیدای واکسن قادر به ایجاد ایمنی در برابر طیف وسیعی از سویهها می باشند، امید است که راه پیشرفت تولید این واکسن را بسیار آسان کنند. |
|
| واژه‌های کلیدی: بیوانفورماتیک، سازه پلی توپی، پروتئین، عامل وبا، واکسن سازی به روش معکوس |
|
|
متن کامل [PDF 792 kb]
(1009 دریافت)
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
تخصصی متفرقه
دریافت: 1399/6/7 | پذیرش: 1399/8/26 | انتشار: 1399/8/30
|
|
|
|
|
|
|
| ارسال نظر درباره این مقاله |
|
|
|
