موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران ، shobbar@abrii.ac.ir
چکیده: (2305 مشاهده)
تنش خشکی یکی از مهمترین عوامل محدود کننده تولید در بخش کشاورزی است. استفاده از گیاهان جایگزین متحمل به خشکی با کارآیی مصرف آب بالا از اهمیت به‌سزایی برخوردار است. ارزن دم‌روباهی (Setaria italicaL.) یکی از غلات مهم غذایی و علوفه ای متحمل به خشکی در مناطق خشک و نیمهخشکاست. در این مطالعه، QTLهای شناسایی شده در شرایط آبیاری معمول و تنش خشکی، از مقالات مختلف گردآوری و روی نقشه ژنتیکی تلفیقی کروموزوم‌های ارزن مکان‌یابی شدند. از مجموع هشت مطالعه مستقل، تعداد 386 QTL مرتبط با صفات ارتفاع گیاه، کارایی مصرف آب، زیست توده، طول ریشه و طول پانیکول در ارزن دم‌روباهی جمع‌آوری شد. در شرایط آبیاری عادی و تنش خشکی به ترتیب تعداد 287 و 96 ناحیه QTL جمع‌آوری شد و روی نقشه مرجع ژنتیکی قرار گرفتند.متاآنالیز QTLهابا استفاده از نرم‌افزار BioMercator در نسخه 2/4 صورت گرفت. در مجموع تعداد 32 ناحیه متا QTL (MQTL) روی نه کروموزوم ارزن دم‌روباهی شناسایی شد که به طور میانگین فاصله اطمینان نواحی MQTL به نسبت4/3 برابر کمتر از فاصله اطمینان QTLهای اولیه در مجموع صفات مورد بررسی بود. به‌منظور بررسی الگوی بیان ژنها در نواحی MQTL، داده های ریزآرایه و RNA-seq موجود در پایگاه دادهها مورد آنالیز قرار گرفتند. از این بین تعداد 95 و 2172 ژن دارای بیان افتراقی در شرایط خشکی به ترتیب در چهار ناحیه MQTL با CI کمتر از یک میلیون جفت باز و در تمام مناطق MQTLها شناسایی‌شدند.در آنالیز "هاب" تعداد هشت ژن کلیدی شناسایی شد که جزو گروه عوامل تنظیمی و فاکتورهای رونویسی بودند. امید است نتایج این مطالعه بتواند در راستای گزینش مبتنی بر نشانگر (MAS) و استفاده در برنامه‌های به‌نژادی ارزن دم‌روباهی با هدف معرفی ژنوتیپ‌های برتر متحمل به خشکی مورد استفاده قرار گیرد.
Loni F, Ismaili A, Shobbar Z, Nakhoda B, Darzi Ramandi H. Identification of the drought tolerance involved candidate genes in foxtail millet through an integrated meta-analysis approach. gebsj 2022; 11 (1) : 3 URL: http://gebsj.ir/article-1-416-fa.html
لونی فاطمه، اسماعیلی* احمد، شبر زهرا سادات، ناخدا بابک، درزی رامندی هادی. شناسایی ژنهای نامزد دخیل در تحمل به خشکی ارزن دم‌روباهی با استفاده از رویکرد متاآنالیز تلفیقی. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1401; 11 (1) :25-41
