گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران ، marashi@um.ac.ir
چکیده: (2051 مشاهده)
پسته یکی از مهمترین محصولات باغی است که به دلیل دوپایه بودن و هتروزیگوسیتی بالا، دارای تنوع ژنتیکی زیادی است، از این رو شناسایی تنوع ژنتیکی موجود در بین ژنوتیپهای پسته در جهت اصلاح و تولید ارقام مقاوم به پسیل اهمیت ویژهای دارد. پسیل پسته یکی از مهمترین آفات درخت پسته است که پوره و حشرات بالغ این آفت با مصرف شیره گیاه سبب افزایش میزان پوکی، عدم خندانی و همچنین کاهش عملکرد میشود. در این پژوهش چندشکلیهای تکنوکلئوتیدی و حذف و اضافه کوچک در چند رقم ایرانی پسته حساس (اکبری، کله قوچی، احمدآقایی، ممتاز) و مقاوم (بادامی زرند، حاج عبداللهی، ایتالیایی، سرخس) به پسیل مورد بررسی قرار گرفت. ابتدا خوانشها با ژنوم مرجع همردیف شدند و سپس چندشکلیهای تکنوکلئوتیدی و حذف و اضافههای کوچک مشخص شدند. درصد همردیفی خوانشها با ژنوم مرجع بالای 96 درصد بود که نشان دهنده کیفیت بالای همردیفی بود. ارقام حساس به ترتیب دارای 2920688 و 701109 و ارقام مقاوم دارای 2919898 و 701000 چندشکلی تکنوکلئوتیدی و حذف و اضافه کوچک بود. در مجموع، نتایج تجزیه و تحلیل دادهها نشان داد که تنوع ساختاری و چندشکلی تکنوکلئوتیدی و حذف اضافه کوچک ژنوم در ارقام حساس بیشتر از ارقام مقاوم است.
Saadati Jebeli M, Marashi H, Shahriari F, Seifi A, Fekrat L. Evaluation of genomic diversity of pistachio resistant and susceptible cultivars to pest psyllid using whole genome sequencing approach. gebsj 2022; 11 (1) : 6 URL: http://gebsj.ir/article-1-420-fa.html
سعادتی جبلی مرضیه، مرعشی حسن، شهریاری فرج الله، سیفی علیرضا، فکرت لیدا. بررسی تنوع ژنومی ارقام پسته مقاوم و حساس به آفت پسیل با استفاده از روش توالییابی کل ژنوم. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1401; 11 (1) :64-71