[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
برای داوران::
ثبت نام و اشتراک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
بایگانی مقالات زیر چاپ::
::
::
راهنمای نگارش
..
شماره‌های چاپ شده

فایل لیست داوران مقالات 

دوره پانزدهم سال 1405
شماره اول
شماره دوم

دوره چهاردهم سال 1404
شماره اول
شماره دوم

دوره سیزدهم سال 1403
شماره اول
شماره دوم

دوره دوازدهم سال 1402
شماره اول
شماره دوم

دوره یازدهم سال 1401
شماره اول
شماره دوم
دوره دهم سال 1400
شماره اول
شماره دوم
دوره نهم سال 1399
شماره اول
شماره دوم
دوره هشتم سال 1398
شماره اول
شماره دوم

دوره هفتم سال 1397
دوره ششم سال 1396
دوره پنجم سال 1395
دوره چهارم سال 1394
دوره سوم سال 1393
دوره دوم سال 1392
دوره اول سال 1391
..
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
:: دوره 13، شماره 2 - ( 10-1403 ) ::
جلد 13 شماره 2 صفحات 234-225 برگشت به فهرست نسخه ها
گزارش وقوع و بررسی تنوع ژنتیکی جدایه‌های مختلف لکه زرد خربزه از برخی از استان‌های ایران
مهرداد صالح زاده* ، علیرضا افشاریفر
مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران. ، mehrdadsalehzadeh@gmail.com
چکیده:   (1007 مشاهده)
طی یک بررسی در بهار و تابستان 1403، از گلخانه­ های اطراف شهر اصفهان، شیراز، بندرعباس، بوشهر و یزد در مرکز و جنوب ایران، لکه‌های زرد شدید، موزاییک و بدشکلی برگ، زردی، نکروز میوه و علائم لکه‌های حلقه‌ای کلروتیک بر روی میوه گیاهان خیار کشت‌شده مشاهده شد. برای ارزیابی آلودگی جدایه­ها به ارتوتوسپوویروس­ها،RNA  ژنومی کل از هر منطقه 5 جدایه مستقل نمونه­برداری شده به‌صورت جداگانه استخراج شد و یک جدایه بدون علامت نیز به عنوان شاهد منفی انتخاب که بعدا توسط کارهای مولکولی عاری بودن آن از ارتوتوسپوویروس­ها محرز گردید.. نمونه‌های RNA استخراج‌شده متعاقباً با استفاده از یک جفت آغازگر دژنره  ارتوتوسپوویروسها  با آزمون RT-PCR مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج مولکولی تحقیقات نشان داد از نمونه­های آلوده یک قطعه مورد انتظار با اندازه 420  جفت باز تکثیر شد. برای بررسی احتمال آلودگی مخلوط جدایه­ها با ویروس­های مهم بیمارگر در سبزیجات شامل توباموویروس­ها، پوتکس­ویروس­ها، بگوموویروس­ها و پوتی­ویروس­ها بررسی و مشخص گردید، جدایه­های مورد بررسی آلودگی مخلوط با گروه­های ویروسی مذکور نشان ندادند. زیرهمچینی توالی­های نوکلئوتیدی جدایه­های ایرانی و ترسیم درخت تبارنمای مربوطه آلودگی جدایه­ها به ویروس لکه زرد خربزه را  نشان داد. این اولین گزارش از وقوع ویروس لکه زرد خربزه (MYSV) از ایران است.

 
واژه‌های کلیدی: ایران، اورتوتوسپوویروس، تنوع ژنتیکی، ویروس لکه زرد خربزه.
متن کامل [PDF 619 kb]   (133 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: مهندسی ژنتیک میکروارگانیسم ها و ویروسها
دریافت: 1403/10/3 | پذیرش: 1403/12/11 | انتشار: 1404/5/13
فهرست منابع
1. Bald-Blume, N., Bergervoet, J. H., & Maiss, E. (2017). Development of a molecular assay for the general detection of tospoviruses and the distinction between tospoviral species. Archives of virology, 162, 1519-1528. https://doi.org/10.1007/s00705-017-3256-x [DOI:10.1007/s00705-017-3256-x.] [PMID] [PMCID]
2. Chen, T. C., Lu, Y. Y., Cheng, Y. H., Chang, C. A., & Yeh, S. D. (2008). Melon yellow spot virus in watermelon: a first record from Taiwan. Plant Pathology, 57(4), 765. https://doi.org/10.1111/j.1365-3059.2007.01791.x [DOI:10.1111/j.1365-3059.2007.01791.x.]
3. Deng, D., McGrath, P. F., Robinson, D. J., & Harrison, B. D. (1994). Detection and differentiation of whitefly-transmitted geminiviruses in plants and vector insects by the polymerase chain reaction with degenerate primers. Annals of applied Biology, 125(2), 327-336. https://doi.org/10.1111/j.1744-7348.1994.tb04973.x [DOI:10.1111/j.1744-7348.1994.tb04973.x.]
4. Gibbs, A., & Mackenzie, A. (1997). A primer pair for amplifying part of the genome of all potyvirids by RT-PCR. Journal of Virological Methods, 63(1-2), 9-16. https://doi.org/10.1016/S0166-0934(96)02103-9 [DOI:10.1016/S0166-0934(96)02103-9.] [PMID]
5. Gholizadeh-Roshanagh, S., Nourinejhad Zarghani, S., Aminian, H., Jafari, M., & Ramshini, H. (2017). Imported infected cucurbit seeds provoked the establishment and spread of central Europe isolates of Zucchini yellow mosaic virus in Varamin (Sothern Tehran, Iran). Genetic Engineering and Biosafety Journal, 5(2), 91-99. https://dor.isc.ac/dor/20.1001.1.25885073.1395.5.2.10.7.
6. Iwaki, M., Honda, Y., Hanada, K., Tochihara, H., Yonaha, T., Hokama, K., & Yokoyama, T. (1984). Silver mottle disease of watermelon caused by tomato spotted wilt virus. Plant Disease, 68(11), 1006-1008. DOI: 10.1094/PD-68-1006. [DOI:10.1094/PD-68-1006]
7. Jensen, S. E. (2000). Insecticide resistance in the western flower thrips, Frankliniella occidentalis. Integrated Pest Management Reviews, 5(2), 131-146. https://doi.org/10.1023/A:1009600426262 [DOI:10.1023/A:1009600426262.]
8. Kato, K., Handa, K., & Kameya-Iwaki, M. (2000). Melon yellow spot virus: a distinct species of the genus Tospovirus isolated from melon. Phytopathology, 90(4), 422-426. https://doi.org/10.1094/PHYTO.2000.90.4.422 [DOI:10.1094/PHYTO.2000.90.4.422.] [PMID]
9. Ghosh, A., Jagdale, S. S., Basavaraj, Dietzgen, R. G., & Jain, R. K. (2020). Genetics of Thrips palmi (Thysanoptera: Thripidae). Journal of Pest Science, 93, 27-39. https://doi.org/10.1007/s10340-019-01160-2 [DOI:10.1007/s10340-019-01160-2.]
10. Li, Y., Tan, G., Lan, P., Zhang, A., Liu, Y., Li, R., & Li, F. (2018). Detection of tobamoviruses by RT-PCR using a novel pair of degenerate primers. Journal of Virological Methods, 259, 122-128. https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2018.06.012 [DOI:10.1016/j.jviromet.2018.06.012.] [PMID]
11. Stadejek, T., Stankevicius, A., Murtaugh, M. P., & Oleksiewicz, M. B. (2013). Molecular evolution of PRRSV in Europe: current state of play. Veterinary microbiology, 165(1-2), 21-28. https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2013.02.029 [DOI:10.1016/j.vetmic.2013.02.029.] [PMID]
12. Maris, P. C., Joosten, N. N., Goldbach, R. W., & Peters, D. (2004). Tomato spotted wilt virus infection improves host suitability for its vector Frankliniella occidentalis. Phytopathology, 94(7), 706-711. https://doi.org/10.1094/PHYTO.2004.94.7.706 [DOI:10.1094/PHYTO.2004.94.7.706.] [PMID]
13. McLeish, M. J., Zamfir, A. D., Babalola, B. M., Peláez, A., Fraile, A., & García-Arenal, F. (2022). Metagenomics show high spatiotemporal virus diversity and ecological compartmentalisation: Virus infections of melon, Cucumis melo, crops, and adjacent wild communities. Virus Evolution, 8(2), 1-16. https://doi.org/10.1093/ve/veac095 [DOI:10.1093/ve/veac095.] [PMID] [PMCID]
14. Quito-Avila, D. F., Peralta, E. L., Martin, R. R., Ibarra, M. A., Alvarez, R. A., Mendoza, A., & Ochoa, J. (2014). Detection and occurrence of melon yellow spot virus in Ecuador: an emerging threat to cucurbit production in the region. European journal of plant pathology, 140, 193-197. https://doi.org/10.1007/s10658-014-0454-1 [DOI:10.1007/s10658-014-0454-1.]
15. Rojas, M. R., Gilbertson, R. L., Russell, D. R., & Maxwell, D. P. (1993). Use of degenerate primers in the polymerase chain reaction to detect whitefly-transmitted geminiviruses. Plant Disease, 77(4), 340-347. http://dx.doi.org/10.1094/PD-77-0340. [DOI:10.1094/PD-77-0340]
16. Rotenberg, D., Jacobson, A. L., Schneweis, D. J., & Whitfield, A. E. (2015). Thrips transmission of tospoviruses. Current opinion in virology, 15, 80-89. https://doi.org/10.1016/j.coviro.2015.08.003 [DOI:10.1016/j.coviro.2015.08.003.] [PMID]
17. Sievers, F., & Higgins, D. G. (2018). Clustal Omega for making accurate alignments of many protein sequences. Protein Science, 27(1), 135-145. https://doi.org/10.1002/pro.3290 [DOI:10.1002/pro.3290.] [PMID] [PMCID]
18. Salehzadeh M., Afsharifar A., Dehghanpour Farashah S. and Rezaei M. 2022. The first report of the Chilli leaf curl virus and its beta satellite from bell peppers and tomatoes from the central provinces of Iran. Iranian Journal of Plant Pathology 57(4), 337-341. [DOI:10.22034/ijpp.2022.549473.384.]
19. Salehzadeh M., Afsharifar A., dehghanpour farashah S., and rezaei,. 2021. The first report of mild pepper mild mottle virus in mixed infection with Tomato brown rugose fruit virus from pepper in Isfahan province. Iranian Journal of Plant Pathology, 57(3), 263-267. doi: 10.22034/ijpp.2022.549587.385.
20. Salehzadeh M., Afsharifar A., & dehghanpour farashah S. 2024. The First Report of Alfalfa mosaic virus Occurrence on Pepper and Tomato Crops Based on Partial Nucleotide Sequence analysis of the Virus Coat Protein Open Reading Frame from Hormozgan Province. Iranian Journal of Plant Pathology, 59(1), 64-68. doi: 10.22034/IJPP.2024.2021784.441.
21. Salehzadeh, M. (2018). Survey on presence of Cucumber mosaic virus (CMV) in single and mixed infections with potyviruses in North-West of Iran. Genetic Engineering and Biosafety Journal, 7(2), 163-173. https://dor.isc.ac/dor/20.1001.1.25885073.1397.7.2.4.5.
22. Tajik Khademi, H., Khodadadi, M., Hassanpanah, D., & Hajainfar, R. (2024). Changes in fruit yield, biochemical attributes, and leaf minerals of different cucumber (Cucumis sativus L.) cultivars under foliar application of silicon nanoparticles. Environmental Science and Pollution Research, 31(29), 42012-42022. https://doi.org/10.1007/s11356-024-33890-x [DOI:10.1007/s11356-024-33890-x.] [PMID]
23. Tamura, K., Dudley, J., Nei, M., & Kumar, S. (2007). MEGA4: molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0. Molecular biology and evolution, 24(8), 1596-1599. https://doi.org/10.1093/molbev/msm092 [DOI:10.1093/molbev/msm092.] [PMID] [PMCID]
24. Takeuchi, S., Okuda, M., Hanada, K., Kawada, Y., & Kameya, M. (2001). Spotted wilt disease of cucumber (Cucumis sativus) caused by Melon yellow spot virus. Japanese Journal of Phytopathology, 67(1), 46-51. https://doi.org/10.3186/jjphytopath.67.46 [DOI:10.3186/jjphytopath.67.46.]
25. Takeuchi, S., Shimomoto, Y., & Ishikawa, K. (2009). First report of Melon yellow spot virus infecting balsam pear (Momordica charantia L.) in Japan. Journal of General Plant Pathology, 75(2), 154-156. https://doi.org/10.1007/s10327-009-0143-7 [DOI:10.1007/s10327-009-0143-7.]
26. Tamura, K., Dudley, J., Nei, M., & Kumar, S. (2007). MEGA4: molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0. Molecular Biology and Evolution, 24(8), 1596-1599. [DOI:10.1093/molbev/msm092] [PMID] [PMCID]
27. Wu, H., Liu, M., Li, W., Wang, M., Xiu, J., Peng, B., & Gu, Q. (2024). Development and Application of Droplet Digital PCR Assay for the Detection of Watermelon Silver Mottle Virus and Melon Yellow Spot Virus. Horticulturae, 10(3), 1-11. https://doi.org/10.3390/horticulturae10030199 [DOI:10.3390/horticulturae10030199.]
ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Salehzadeh M, Afsharifar A. Report on the occurrence and genetic diversity of melon yellow spot virus isolates in various provinces of Iran. gebsj 2025; 13 (2) :225-234
URL: http://gebsj.ir/article-1-506-fa.html

صالح زاده مهرداد، افشاریفر علیرضا. گزارش وقوع و بررسی تنوع ژنتیکی جدایه‌های مختلف لکه زرد خربزه از برخی از استان‌های ایران. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1403; 13 (2) :225-234

URL: http://gebsj.ir/article-1-506-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 13، شماره 2 - ( 10-1403 ) برگشت به فهرست نسخه ها
دوفصل نامه علمی-پژوهشی مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی Genetic Engineering and Biosafety Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.12 seconds with 39 queries by YEKTAWEB 4758